行政程序违法时，行政复议的时间规定主要依据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，具体如下：
一般期限：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》第九条，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请；但是法律规定的申请期限超过六十日的除外。这意味着，在大多数情况下，如果认为行政程序违法，应在知道该违法行为之日起六十日内申请行政复议。
特殊期限：
- 如果因不可抗力或者其他正当理由耽误法定申请期限的，申请期限自障碍消除之日起继续计算。例如，如果因自然灾害、战争等不可抗力因素导致无法及时申请行政复议，那么在障碍消除后，可以继续计算剩余的申请期限。
- 此外，如果法律、法规对申请期限有特别规定的，如某些特定类型的行政行为可能有更长的或更短的申请期限，那么应遵循这些特别规定。
复议机关的处理期限：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》第三十一条，行政复议机关应当自受理申请之日起六十日内作出行政复议决定；但是法律规定的行政复议期限少于六十日的除外。情况复杂，不能在规定期限内作出行政复议决定的，经行政复议机关的负责人批准，可以适当延长，并告知申请人和被申请人；但是延长期限最多不超过三十日。这意味着，复议机关在受理申请后，通常应在六十日内作出决定，特殊情况下可延长三十日。
在申请行政复议时，还需要注意以下几点：
- 申请方式：申请人可以书面申请，也可以口头申请。口头申请的，行政复议机关应当当场记录申请人的基本情况、行政复议请求、申请行政复议的主要事实、理由和时间。
- 申请材料：申请人申请行政复议时，应提交行政复议申请书、身份证明、相关证据材料等。如果委托他人代为申请，还应提交授权委托书。
- 复议结果：行政复议决定作出后，申请人如果不服，可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起行政诉讼。
举例说明：
假设某市民认为某市政府的拆迁决定程序违法，侵犯了其合法权益。该市民在知道拆迁决定之日起的第五十日内，向市政府提出了行政复议申请。市政府在受理申请后，经过审查，认为拆迁决定确实存在程序违法的情况，于是在六十日内作出了撤销原拆迁决定的行政复议决定。这就是一个典型的行政程序违法时申请行政复议的案例。
最后，如果您在行政复议过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。