若公司已注销且被起诉涉及劳动关系问题，核心处理方式需分情况讨论，具体如下：

1. 确认公司注销程序是否合法合规
   公司注销需完成清算程序，包括通知债权人、公告、清理债权债务等。若清算组未依法履行通知义务（尤其是未通知已知债权人如员工），或存在故意隐瞒债务、虚假清算等情形，根据《公司法司法解释（二）》第11-20条，股东或清算组成员可能需对债务承担赔偿责任。此时，员工可追加股东或清算组成员为被告，要求其承担劳动争议项下的工资、经济补偿等责任。

2. 核查公司注销时是否已处理劳动关系债务
   若公司在注销时已通过清算程序清偿员工工资、社保、经济补偿等债务（如留存工资发放记录、补偿协议、社保缴纳凭证等），且员工在清算期间未申报债权（或已申报但被依法处理），则公司注销后员工再起诉的，法院可能以“主体不适格”或“债务已清偿”为由驳回诉求。但若员工能证明公司存在恶意注销（如未通知员工申报债权、虚构清算报告等），仍可突破公司注销的屏障，追究相关责任人。

3. 若公司未依法清算即注销，员工如何维权
   根据《公司法》第183条及《公司法司法解释（二）》第18-20条，若公司未经依法清算即办理注销登记，导致员工无法主张债权，员工可起诉公司股东、控股股东、实际控制人或清算义务人（如董事），要求其对公司债务承担连带清偿责任。此时需重点收集证据：公司注销时的清算报告（若虚假）、股东会决议（注销决议）、工商登记档案（证明注销时间）、员工与公司存在劳动关系的证明（劳动合同、工资流水、社保记录等）。

4. 若公司注销后被起诉，被告主体如何确定
   若公司已注销，原则上不再具备诉讼主体资格，但存在例外：

   • 若公司注销时未依法清算，员工可起诉股东或清算义务人；
     
   • 若公司注销后仍有剩余财产未分配，员工可申请参与分配；
     
   • 若公司注销时存在未了结的诉讼（如劳动仲裁已受理但未结案），可申请变更诉讼主体为股东或清算义务人。
     关键点：需通过工商档案、清算报告等证据，证明公司注销程序存在瑕疵，从而锁定责任主体。

行动建议：

• 立即收集公司注销的相关材料（如清算报告、股东会决议、工商注销登记信息）；
  
• 整理劳动关系证明（劳动合同、工资流水、考勤记录、离职证明等）；
  
• 若公司注销程序违法，尽快向法院申请追加股东或清算义务人为被告；
  
• 同步向劳动监察部门投诉（若涉及欠薪等违法行为），形成多维度维权压力。
  

提示：公司注销不等于“债务消失”，尤其是劳动关系项下的工资、补偿等，属于法定优先清偿债务。若您手头有具体材料（如注销公告、清算报告片段等），可进一步向我描述，我会帮您分析责任主体及维权路径。