结论概述：
- 资金监管账户未按协议期限存入，交易不一定会自动失效，这取决于协议中的具体约定。
- 定金是否退还也需依据协议内容及实际情况判断，并非绝对不退还或必须退还。
详细分析：
一、交易是否自动失效
在合同纠纷中，资金监管账户的开立及资金存入是交易流程中的重要环节。然而，交易是否因未按协议期限存入资金而自动失效，并非由法律直接规定，而是取决于双方签订的协议内容。
- 协议有明确约定：如果协议中明确规定了资金存入的时间节点，并约定了未按期存入的后果（如交易自动失效），则双方应遵守该约定。此时，若一方未按期存入资金，交易可能因违约而自动失效。
- 协议无明确约定或约定不明：若协议中未明确约定未按期存入资金的后果，或约定不明，则交易不会因单方面未按期存入资金而自动失效。此时，双方应协商解决，或依据相关法律法规及交易习惯处理。
二、定金是否退还
定金作为合同担保的一种方式，其退还问题同样需依据协议内容及实际情况判断。
- 协议有明确约定：如果协议中明确规定了定金的退还条件（如因买方原因导致交易失败，定金不予退还；或因卖方原因导致交易失败，定金双倍退还等），则双方应遵守该约定。
- 协议无明确约定或约定不明，且交易因违约而失效：
- 若因买方违约导致交易失效：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，买方作为违约方，可能无权要求退还定金。但具体还需看协议内容及双方协商结果。
- 若因卖方违约导致交易失效：卖方作为违约方，应退还买方已支付的定金，并可能需承担额外的赔偿责任。
- 协议无明确约定或约定不明，且交易非因违约而失效：如因不可抗力、政策调整等不可归责于双方的原因导致交易失效，定金通常应退还买方，但双方也可协商其他处理方式。
三、建议与注意事项
- 仔细审查协议内容：在签订涉及资金监管及定金的协议时，务必仔细审查协议内容，明确双方的权利义务及违约责任。
- 及时沟通协商：若因特殊情况无法按期存入资金或交易出现其他问题，应及时与对方沟通协商，寻求解决方案。
- 保留相关证据：在交易过程中，应保留好与交易相关的所有证据（如协议、付款凭证、沟通记录等），以备不时之需。
- 寻求法律帮助：若双方无法协商解决或对协议内容存在争议，可寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自身权益。
四、特殊情况说明
在实际操作中，还可能存在一些特殊情况（如协议部分无效、情势变更等），这些情况可能影响交易的效力及定金的退还。因此，在处理具体案件时，需结合实际情况进行综合分析判断。
总结：资金监管账户未按协议期限存入资金，交易是否自动失效及定金是否退还，均需依据协议内容及实际情况判断。在处理此类问题时，建议双方仔细审查协议内容、及时沟通协商、保留相关证据，并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。