若土地纠纷在村委调解后，双方已按手印并盖章，但有一方违规，可按以下步骤处理：

1. 确认调解协议的法律效力
   首先，需明确村委调解协议的性质。根据《人民调解法》，经调解达成的协议具有民事合同性质，双方签字（按手印）并盖章后即生效。若协议内容合法、双方自愿，则对双方具有约束力。若一方违反协议，另一方可依据协议主张权利。

2. 收集证据证明违规行为
   若一方违反协议，需收集相关证据，例如：

   • 调解协议原件（证明双方约定内容）；
     
   • 对方违规的直接证据（如占用土地、破坏设施的照片、视频、证人证言等）；
     
   • 村委调解过程的记录（如调解笔录、签字盖章的证明材料）。
     证据充分是后续维权的关键。

3. 通过村委或上级部门再次协调
   可先联系村委，要求其协助督促违约方履行协议。若村委调解无效，可向乡镇政府或街道办的司法所、人民调解委员会申请二次调解。调解是低成本、高效率的解决方式，建议优先尝试。

4. 向法院提起民事诉讼
   若调解无果，可直接向法院起诉，要求违约方：

   • 履行调解协议（如返还土地、赔偿损失等）；
     
   • 承担违约责任（如支付违约金、赔偿实际损失）。
     诉讼时需提交调解协议、违约证据等材料，法院将根据事实和法律作出判决。

5. 申请强制执行
   若法院判决违约方履行义务，但其仍不执行，可向法院申请强制执行。法院可通过查封、扣押财产、限制高消费等措施迫使对方履行。

温馨提示：

• 调解协议虽具有合同效力，但若涉及土地权属争议（如土地所有权、使用权归属），可能需先通过行政程序（如土地确权）解决，再处理违约问题。
  
• 若违约行为涉嫌侵占土地、破坏财物等违法行为，可同时向公安机关报案，追究其行政或刑事责任。
  

如有具体细节需进一步分析，可直接向我咨询，我会结合实际情况提供更详细的建议。