结论：在直行右转车道红灯时停在第二车位直接右转是否违法，需根据路口的交通信号和标志来判断。若路口无右转箭头指示灯且为圆形红灯，在确保安全、不妨碍被放行的车辆和行人通行的前提下，通常可以右转；若有右转箭头指示灯或路口设有禁止右转的标志，则红灯时右转属于违法行为。

详细分析：

1. 没有右转箭头指示灯，只有圆形红灯

   • 在这种情况下，红灯亮起主要禁止的是直行方向的车辆通行。考虑到右转车辆对横向道路车辆和行人的影响相对较小，因此在确保安全、不妨碍被放行的车辆和行人通行的前提下，是允许右转的。这是基于交通流控制的灵活性和实际道路情况的考量。但需要注意的是，即使可以右转，也必须确保安全，不能强行右转或忽视其他交通参与者的安全。

2. 有右转箭头指示灯

   • 右转箭头显示红灯：此时右转属于明确的违规行为，等同于闯红灯。因为右转箭头指示灯明确指示了右转车辆的通行状态，红灯即表示禁止右转。如果此时右转，将面临相应的处罚，如罚款和扣分。
   • 右转箭头显示绿灯或闪烁提示：此时车辆可以正常右转，不属于违规行为。绿灯表示允许通行，而闪烁提示通常也视为允许右转的信号，但同样需要注意安全，确保不妨碍其他车辆和行人的通行。

3. 路口标志与特殊规定

   • 无论路口是否有右转箭头指示灯，如果路口设有明确的“红灯亮时禁止右转”的标志，或者当地交通法规有特殊规定（如某些特定时间段或特定路口禁止红灯时右转），那么红灯时右转都是违规的。因此，驾驶人在行车过程中应仔细观察路口的交通标志和信号灯，以确保合规行驶。

法律建议：

• 遵守交通信号和标志：驾驶人在行车过程中应严格遵守交通信号和标志的指示，确保合规行驶。在不确定是否可以右转的情况下，最好等待绿灯亮起或找到明确的右转信号后再行动。
• 注意安全：即使可以右转，也必须确保安全，不能强行右转或忽视其他交通参与者的安全。在右转前，应仔细观察周围交通情况，确保没有妨碍被放行的车辆和行人通行。
• 咨询当地交通管理部门：如果对当地交通法规或路口信号设置有疑问，可以咨询当地的交通管理部门或查看相关的交通法规手册以获取更准确的信息和指导。

可能后果：

• 如果红灯时右转属于违规行为，将面临相应的处罚，如罚款和扣分。具体处罚标准可能因地区而异，但通常闯红灯的处罚较为严厉，包括罚款和扣6分等。
• 如果因红灯时右转导致交通事故或妨碍其他车辆和行人通行，还可能承担相应的法律责任和赔偿责任。

综上所述，在直行右转车道红灯时停在第二车位直接右转是否违法，需综合考虑路口的交通信号、标志以及当地交通法规的具体规定。驾驶人应时刻保持警惕，遵守交通规则，确保行车安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。