没收违法所得案件的管辖机关主要依据案件性质及具体法律法规来确定，一般由作出没收决定的机关来执行。以下是对此问题的详细解析：
一、刑事诉讼领域
执行机关：
- 在刑事诉讼中，没收违法所得的执行机关主要是人民法院。在必要的时候，人民法院可以会同公安机关共同执行。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于犯罪嫌疑人、被告人逃匿、死亡案件违法所得的没收程序，以及刑事裁判中涉及财产的部分，如没收违法所得，一般由第一审人民法院执行。若第一审人民法院认为情况特殊需要由第二审人民法院执行的，也可以报请第二审人民法院执行。
执行流程：
- 人民法院首先根据生效的刑事裁判文书确定违法所得的范围和数额，然后向相关单位和个人发出协助执行通知书，要求其配合执行，如冻结、划拨银行款项，查封、扣押、拍卖财物等。若遇抗拒执行，人民法院可采取强制措施保障执行。
二、行政执法领域
在行政执法过程中，不同行政机关根据其法定职责负责执行没收违法所得，具体包括：
市场监督管理部门：
- 职责：查处市场交易中的违法行为，如虚假宣传、销售假冒伪劣产品等，并执行没收违法所得。
- 执行程序：市场监督管理部门在作出处罚决定后，向当事人送达处罚决定书，要求限期缴纳违法所得。逾期不履行的，市场监督管理部门可采取加处罚款、申请人民法院强制执行等措施。
税务部门：
- 职责：针对税收违法行为，如偷税、漏税等，执行没收违法所得。
- 执行程序：税务部门通过查询银行账户、财务资料等方式确定违法所得数额，要求纳税人限期缴纳。拒不缴纳的，税务部门可采取税收保全措施和强制执行措施。
公安机关：
- 职责：在治安管理、禁毒、打击经济犯罪等方面，有权对相关违法行为执行没收违法所得，如赌博、非法经营等。
- 执行程序：公安机关依法对涉案财物进行查封、扣押、冻结，调查核实后予以没收。需要拍卖、变卖的财物，按法定程序处理，所得款项上缴国库。
三、特殊情形下的执行主体
海关等特殊部门：
- 对于海关等部门作出的没收违法所得的处罚决定，如果这些部门没有直接强制执行权，它们可能需要依照《中华人民共和国行政强制法》的有关规定申请人民法院强制执行。
其他行政机关：
- 除了上述特定部门外，其他行政机关在作出没收违法所得的处罚决定后，如果法律、法规赋予其直接强制执行权，则可以直接执行；如果没有直接强制执行权，则需要申请人民法院强制执行。
四、综合判断与建议
在具体案件中，确定哪个机关负责执行没收违法所得，需综合考虑案件性质、相关法律法规及具体情况。若您面临相关问题或疑虑，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供准确的法律指导和帮助。
综上所述，没收违法所得的执行主体因案件性质而异，需严格遵循相关法律法规及程序规定。通过明确各机关的职责和执行程序，有助于保障执法的公正性和效率性。