针对您提出的“虚开3300万元工程发票怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
虚开工程发票是一种严重的违法违规行为，它不仅违反了国家的税收法律法规，还可能给企业带来刑事处罚、行政处罚以及财务风险、信誉损失等多重后果。针对您提到的虚开3300万元工程发票的具体情况，以下是从法律角度进行的详细分析：
一、刑事处罚
根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条的规定，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，构成犯罪。虽然该法条直接提及的是增值税专用发票，但虚开工程款发票同样具有违法性，并可能触犯该法条的相关精神。对于虚开金额巨大（如3300万元）的情况，如果情节严重，可能面临二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；若情节特别严重，则可能面临二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。此外，如果虚开行为是由单位实施的，单位也将被判处罚金，同时对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员进行相应处罚。
二、行政处罚
除了刑事处罚外，虚开发票的行为还将受到税务机关的行政处罚。根据《中华人民共和国税收征收管理法》及《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，虚开发票的行为将受到以下行政处罚：
没收违法所得：税务机关将没收因虚开发票而获得的非法所得。
罚款：对于虚开金额在1万元以下的，可并处5万元以下罚款；超过1万元的，处5万元以上50万元以下罚款。在您提到的3300万元虚开金额的情况下，罚款金额将相当可观。
三、其他风险
除了刑事处罚和行政处罚外，虚开工程发票还可能给企业带来以下风险：
财务风险：虚开工程发票往往伴随虚假资金交易，导致资金回流问题。这可能引起税务部门的怀疑和调查，进而引发更严重的税务处理风险。
信誉风险：一旦被发现存在虚开工程发票行为，企业的商业信誉将严重受损。这可能影响合作伙伴的信任度和市场形象，进而阻碍业务拓展和发展。
四、建议与防范策略
为了避免虚开工程发票带来的法律风险和其他风险，我建议您采取以下措施：
加强内部管理：建立健全内部发票管理制度，明确各环节职责和流程，加强对员工的培训和教育，提高法律意识和风险防范意识。
严格审核交易真实性：在进行工程业务交易时，严格审核交易的真实性和合法性，确保有真实的工程施工和服务提供，并保留相关证明材料。
提高法律意识：加强税法宣传和培训，使员工熟悉相关法律法规和政策要求，严格按照规定开具和使用发票。
积极配合监管检查：积极配合税务机关和其他监管部门的检查工作，如实提供相关资料和信息，及时主动纠正问题，争取从轻处罚。
综上所述，虚开3300万元工程发票将面临严重的刑事处罚和行政处罚，同时还可能给企业带来财务风险和信誉风险。因此，我强烈建议您严格遵守税法规定，加强内部管理，提高法律意识，并采取有效措施防范和应对各种风险。