您好，针对您提出的“货在运输中申请退货应该怎么处理”的问题，这确实是一个涉及多个环节和单证准备的流程。以下是我为您详细梳理的处理步骤和所需单证：

一、确定退运原因及贸易方式

首先，您需要明确退运的原因，比如是品质不合格、规格不符还是其他原因。同时，根据货物当前的状态（是否已办结海关放行手续），确定贸易方式：

1. 直接退运货物：如果货物在进境后、办结海关放行手续前，经海关批准需要退运境外的，按照“直接退运货物”来报关。

2. 退运货物：如果货物已经办结海关放行手续，之后因各种原因需要退运的，则按照“退运货物”的方式来报关。

二、准备退运所需单证

根据退运原因和贸易方式，您需要准备以下单证：

1. 原出口或进口时相关的报关单证：这是证明货物原进出口情况的基础文件。

2. 国内外检验机构出具的有关品质不良或规格不符的证明材料：如果退运原因是品质或规格问题，这是必不可少的证明文件。

3. 报关单及随附单证：

   • 买卖双方关于退货的合同或协议
   • 舱单、提单（证明货物的运输情况）
   • 装箱单、发票（详细列出货物的数量、价值等信息）
   • 进出口许可证件（如果货物需要特殊许可才能进出口）
   • 代理报关授权委托协议（如果委托代理报关）

4. 特殊单证：

   • 如果原出口时海关已签发出口退税报关单的，办理退运进口手续时还须提供税务部门出具的《出口商品退运已补税证明》。

5. 海关要求的其他单证：根据海关的具体要求，可能还需要提供其他相关文件。

三、提交退运申请并办理相关手续

1. 提交退运申请：根据货物的运输方式和当前状态，您可能需要通过掌上海关APP、海关驻邮局办事处或其他指定渠道提交退运申请。

2. 等待海关审核：海关会对您的退运申请进行审核，确认单证齐全且符合退运条件后，会批准退运。

3. 办理退运手续：根据海关的指示，您可能需要前往海关现场办理退运手续，或者通过电子口岸等线上平台完成相关操作。

4. 货物退运：在海关批准退运后，您可以安排货物的退运工作。如果是通过邮寄方式退运，需要确保邮包符合退运要求，并按照邮政部门的规定进行操作。

四、注意事项

1. 及时沟通：在退运过程中，与海关、货运代理或邮政部门保持密切沟通，确保信息的准确传递和手续的顺利办理。

2. 遵守规定：严格按照海关和相关部门的规定办理退运手续，避免因违规操作导致退运受阻或产生额外费用。

3. 保留证据：妥善保管所有与退运相关的单证和文件，以备后续查询或核对。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在退运过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时联系我们。