针对您提出的事业单位法人证书废止但未注销登记的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，事业单位法人证书废止后，必须按照相关规定进行注销登记，以确保法人资格的合法终止和避免潜在的法律风险。
一、注销登记的适用范围与条件
根据《事业单位登记管理暂行条例》及其实施细则，事业单位在以下情形之一时，应当向登记管理机关申请注销登记：
若您的事业单位符合上述任一情形，且已废止法人证书，那么就需要进行注销登记。
二、注销登记的注意事项
清算工作：在申请注销登记前，事业单位应在举办单位和其他有关机关的指导下，成立清算组织，完成清算工作。清算组织需通知债权人，并发布拟申请注销登记的公告，以便债权人申报债权。
禁止活动：清算期间，事业单位不得开展与清算无关的活动，以确保清算工作的顺利进行。
相关事项撤销：在申请注销登记前，事业单位应完成银行账户撤销、社会保险及公积金账户撤销、税务注销等相关事项，确保证书不再使用。
涉密材料处理：在提交注销登记申请时，不要在网上提交涉密材料，以确保信息安全。
法律责任：若不按照条例和实施细则的规定申请注销登记，登记管理机关将根据情况给予书面警告、暂扣法人证书及单位印章、撤销登记并收缴法人证书及单位印章等处罚。
三、注销登记流程
提出申请：事业单位需向登记管理机关提出注销登记申请，并提交相关材料。
审理核准：登记管理机关将对申请材料进行审理，核准注销登记后，将收缴被注销事业单位的法人证书正、副本及单位印章。
发布公告：登记管理机关将发布注销公告，宣布该事业单位法人资格的终止。
四、建议与操作
咨询与准备：在申请注销登记前，建议您先咨询登记管理机关或相关法律专业人士，了解具体流程和所需材料，确保申请工作的顺利进行。
网上操作：若登记管理机关提供网上申请服务，您可以按照网上操作指南进行在线填写、完善申请材料，并提交审核。
跟进进度：在提交申请后，您可以跟进审核进度，及时了解注销登记的办理情况。
综上所述，事业单位法人证书废止后，必须按照相关规定进行注销登记。希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询登记管理机关或相关法律专业人士。