关于公司按最低标准基数交公积金是否合法的问题，这主要取决于员工的实际工资水平与当地规定的最低缴存基数之间的关系，以及公司是否遵循了相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《住房公积金管理条例》第十六条，职工住房公积金的月缴存额应基于职工本人上一年度月平均工资与规定的缴存比例来确定。单位同样需按照这一原则为员工缴存住房公积金。这是判断公司缴纳公积金是否合法的基本依据。
二、合法情形
员工工资低于或等于最低缴存基数：当员工的月工资收入低于或等于当地规定的住房公积金最低缴存基数时，单位按照该最低标准为其缴存住房公积金是符合法律规定的。例如，若当地最低缴存基数为2000元，而某员工月工资为1800元，单位按2000元为基数缴纳即为合法。
特定政策规定：在某些地区或特定情况下，可能存在特殊的公积金缴存政策，允许或要求公司按最低基数缴纳。此时，公司需遵循相关政策执行，这种情况下的缴纳也是合法的。
三、不合法情形
员工工资高于最低缴存基数：如果员工的实际工资高于当地规定的最低缴存基数，但单位却统一按最低标准缴纳，这违反了《住房公积金管理条例》的规定。例如，员工上一年度月平均工资为8000元，而单位却按当地最低缴存基数2000元来缴纳，这种做法是不合法的。
工资超过上限仍按最低缴纳：如果职工上一年度月平均工资高于当地上年度职工平均工资的300%，公司按最低基数缴纳公积金同样是违法的。
四、员工权益与公司责任
住房公积金作为员工的重要福利，对于解决住房问题、提高生活质量具有重要意义。公司应按照员工实际工资水平合理确定缴存基数，以充分保障员工的权益。即使按最低标准缴纳在法律上可能合法，公司也应考虑员工的实际需求和利益，尽可能提高缴存水平，以增强员工归属感和忠诚度，同时提升公司整体形象和竞争力。
五、法律救济途径
若劳动者认为单位缴纳的公积金不符合规定，首先应与单位沟通协商，要求调整缴存基数。协商不成时，可向当地住房公积金管理中心投诉举报，由管理中心责令单位限期改正；逾期不改的，可对单位处以1万元以上5万元以下的罚款。
总结与建议：
公司应严格按照《住房公积金管理条例》及当地相关政策规定来缴纳公积金，确保以职工本人上一年度的月平均工资为基数，按照规定的比例缴存。同时，公司应关注职工的实际工资情况，避免盲目按最低基数缴纳而引发法律风险。通过合规操作，公司可以维护职工的合法权益，促进劳动关系的和谐稳定。如果您对公司缴纳公积金的情况有疑问或不满，建议首先与公司沟通协商，若无法解决，可向当地住房公积金管理中心寻求帮助。