针对“单位副总经理违规，员工怎么处理”这一问题，核心结论需分情况讨论，具体如下：
明确违规性质与影响范围
员工需首先确认副总经理的违规行为性质（如贪污、滥用职权、违反公司制度等）及影响范围（是否涉及员工切身利益，如工资拖欠、权益受损等）。若违规行为直接侵害员工权益（如克扣工资、非法调岗），员工可依据《劳动合同法》第三十八条，以“未及时足额支付劳动报酬”或“未依法提供劳动条件”为由，向单位提出解除劳动合同并主张经济补偿。若违规行为未直接侵害员工权益，但违反公司制度或法律法规，员工可向公司内部合规部门、监事会或工会举报，要求启动内部调查程序。
内部举报与证据固定
若选择内部举报，员工需注意：
- 证据收集：保留违规行为的书面记录（如邮件、文件）、证人证言（如同事目击情况）、视听资料（如录音、录像）等，确保证据真实、合法且与违规行为直接相关。
- 举报渠道：优先通过公司正式渠道（如合规热线、监察部门邮箱）提交举报材料，避免通过非正式途径（如口头传言）传播，以降低法律风险。
- 保密要求：若公司有举报保密制度，员工可要求匿名举报或对个人信息保密，防止因举报遭受报复（如降职、解雇）。根据《劳动法》第八十八条，用人单位以暴力、威胁或非法限制人身自由手段强迫劳动，或侮辱、体罚、殴打、非法搜查和拘禁劳动者的，员工可依法追究单位责任。
外部维权路径
若内部举报无果或违规行为涉嫌违法（如职务侵占、商业贿赂），员工可向外部机构求助：
- 劳动监察部门：向当地劳动保障监察大队投诉，要求对单位违法行为（如拖欠工资、未缴社保）进行查处。
- 公安机关：若违规行为涉嫌犯罪（如贪污、挪用资金），员工可向公安机关报案，提供初步证据协助立案侦查。
- 劳动仲裁/诉讼：若因违规行为导致劳动权益受损（如违法解除劳动合同、未支付经济补偿），员工可申请劳动仲裁或向法院起诉，主张赔偿。
风险防范与自我保护
员工在处理过程中需注意：
- 避免扩大矛盾：举报时保持理性，避免在公开场合指责或散布不实信息，防止被单位以“损害公司声誉”为由追责。
- 保留工作记录：正常履行工作职责，保留考勤、工作成果等证据，防止单位以“旷工”“能力不足”等理由反诉。
- 法律咨询：若对程序或证据要求不确定，可直接向我咨询，我会结合具体案情提供操作建议。
总结：员工处理副总经理违规行为时，需根据违规性质、影响范围及自身权益受损情况，选择内部举报、外部维权或两者结合的方式，同时注重证据固定与风险防范。如有具体细节需进一步分析，可直接向我提问。