结论：有合同但没房产证的情况下能否代开发票，需分情况讨论，主要取决于交易性质、发票类型及税务机关的具体要求。以下从不同角度展开分析：

1. 交易性质与发票类型的影响

• 销售不动产（如二手房交易）：
  根据《发票管理办法》及税务实践，销售不动产需以产权转移为前提。若未取得房产证，通常意味着产权未完成转移登记，此时税务机关可能拒绝代开不动产销售发票。但若合同已明确交易标的、价款且买方已实际占有房屋（如通过法院判决、继承等特殊情形），部分税务机关可能允许代开，但需提供法院文书、公证书等辅助证明。
• 租赁或服务合同：
  若合同内容为租赁房屋或提供服务（如装修、物业等），与房产证无直接关联，税务机关通常允许代开发票。此时需提供合同、付款凭证及身份证明等材料，房产证非必需。

2. 税务机关的具体要求

• 代开发票的通用条件：
  无论交易类型，代开发票需满足：合同真实有效、交易资金流与合同一致、申请人具备纳税义务（如个人需办理临时税务登记）。若合同涉及不动产但无房产证，需额外提供产权归属证明（如购房合同、契税完税凭证等），以佐证交易合法性。
• 地方政策差异：
  部分地区税务机关可能对无房产证交易放宽要求（如农村自建房出租），但需以当地政策为准。建议提前咨询主管税务机关或通过电子税务局查询具体要求。

3. 风险与合规建议

• 法律风险：
  若未取得房产证即代开发票，可能被认定为“虚开发票”（如无实际产权转移），面临罚款甚至刑事责任。此外，买方可能因无法取得合法发票而无法抵扣税款或办理产权登记。
• 合规操作：
  
  1. 优先办理房产证或产权证明文件，再申请代开发票；
     
  2. 若确需提前开票，务必保留合同、付款记录、产权归属证明等材料，以备税务核查；
     
  3. 涉及大额交易时，建议通过公证或律师见证增强合同效力。

总结：无房产证时代开发票需谨慎，需结合交易性质、地方政策及证据完整性综合判断。如有具体案例或地区差异问题，可进一步向我咨询，我会结合实务经验为您详细分析。