刑事案件中书记员办理违反相关规定的情况，主要涉及违反法定职责、程序规范及职业操守等方面，具体可能包括以下情形：

1. 违反法定职责规定
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，书记员的主要职责包括记录庭审活动、整理装订卷宗、协助法官完成程序性事务等。若书记员越权处理应由法官、检察官或侦查人员行使的职权（如决定强制措施、直接认定案件事实等），则构成超越职权，违反《法官法》《人民检察院组织法》中关于司法辅助人员职责边界的规定。

2. 违反程序规范要求

   • 记录失实：若书记员故意篡改庭审笔录、询问笔录等关键证据材料，或因疏忽导致记录内容与实际不符，可能影响案件事实认定，违反《刑事诉讼法》第211条关于“笔录应当交当事人核对无误后签名”的规定，甚至涉嫌《刑法》第305条伪证罪（若与当事人串通）。
     
   • 卷宗管理违规：未按规定保管、移交卷宗材料，导致证据灭失或泄露，可能违反《人民法院档案工作规定》《人民检察院诉讼档案管理办法》，需承担行政纪律责任。

3. 违反职业操守与纪律

   • 泄露案件信息：若书记员向无关人员透露案情、当事人隐私或审判秘密，违反《法官职业道德基本准则》第14条“保守审判秘密”的要求，可能面临警告、记过等处分，情节严重者可能构成《刑法》第398条泄露国家秘密罪。
     
   • 接受利益输送：收受当事人财物或请托，干预案件办理，违反《刑法》第385条受贿罪及《人民法院工作人员处分条例》第31条，需承担刑事责任与纪律处分。

4. 其他特定情形

   • 未回避：若书记员与案件有利害关系（如当事人近亲属）未主动回避，违反《刑事诉讼法》第29条回避制度，可能影响程序公正。
     
   • 拖延履职：故意拖延记录、装订卷宗等，导致案件审理超期，违反《刑事诉讼法》关于办案期限的规定，需承担行政责任。

建议：若发现书记员存在上述违规行为，可通过以下途径维权：

1. 向办案法院的监察部门或上级法院投诉；
   
2. 申请审判监督程序（若行为已影响案件结果）；
   
3. 涉及犯罪的，向公安机关报案。
   

具体问题需结合案件细节分析，如有疑问可直接向我咨询。