结论：现金还款没有留证据，在纪委调查时，一般较难被直接认定，但并非绝对无法证明，具体需结合其他证据和实际情况综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

从证据规则角度

在法律和纪委调查的语境下，证据是认定事实的关键依据。现金还款若没有留下书面凭证（如借条上注明已还款、收条）、转账记录、见证人等直接证据，从证据规则上来说，属于证据缺失。纪委在调查相关案件时，需要依据确凿、充分的证据来认定事实。没有这些直接证据，仅凭当事人一方的陈述，很难形成完整的证据链，也就较难被直接认定还款事实的存在。

举例：比如甲借给乙一笔钱，乙声称已经用现金归还，但甲不承认。如果乙无法提供任何还款的证据，而甲又能提供借条等证明借款事实存在的证据，那么在纪委调查时，从证据规则角度，很难认定乙已经还款。

从实际调查角度

虽然现金还款没有留证据在证据规则上处于不利地位，但纪委在调查过程中，会综合考虑各种因素和线索。如果存在其他间接证据能够佐证还款事实，或者通过调查发现一些异常情况，可能会对还款事实的认定产生影响。

可能存在的间接证据：

1. 还款时的场景证据：如果还款时有其他人在场，虽然这些人不是直接的还款接收方，但他们的证言可能在一定程度上佐证还款事实。不过，见证人的证言需要真实、可靠，且能够与其他证据相互印证。
2. 还款后的行为表现：比如借款人在还款后，对借款的态度发生了明显变化，不再像之前那样关注借款的归还情况，或者双方在还款后有一些与借款相关的对话记录（虽然不是直接的还款证据，但可能反映出还款的事实）。
3. 资金来源证据：如果还款人能够提供证据证明自己在还款时有足够的现金来源，比如取款记录、工资收入等，也可能在一定程度上支持还款事实的存在。

举例：乙声称用现金归还了甲的借款，虽然没有直接证据，但乙能够提供在还款前几天从银行取款的记录，且取款金额与借款金额相符。同时，甲在还款后的一段时间内，不再向乙催讨借款，且双方在聊天中甲也暗示过借款已经还清。在这种情况下，纪委可能会结合这些间接证据，综合判断还款事实是否存在。

法律建议

1. 尽量保留证据：在进行现金还款时，一定要养成保留证据的好习惯。可以让对方出具收条，或者在借条上注明已经还款的情况，并由双方签字确认。如果有见证人，最好让见证人也在相关凭证上签字。
2. 及时补充证据：如果已经进行了现金还款但没有留证据，可以尝试通过其他方式补充证据。比如与对方进行沟通，通过录音、聊天记录等方式，让对方承认已经还款的事实。但需要注意的是，录音、聊天记录等证据的取得要合法，不能侵犯他人的合法权益。
3. 积极配合调查：如果纪委介入调查，要积极配合调查工作，如实陈述还款的情况，并提供自己能够提供的所有证据和线索。同时，也可以向纪委说明自己没有留证据的原因和实际情况，争取纪委的理解和认可。

如果你在现金还款方面遇到了类似的问题，或者有其他债权债务方面的疑问，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。