公司规定旷工一天扣三天工资，这样的规定通常是违法的。以下从法律依据、合理性分析以及劳动者应对措施三个维度为你详细解释：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有法定事由或双方约定的事由，否则用人单位不能随意扣除劳动者的工资。

2. 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这一条款限制了用人单位扣款的额度和条件，而“旷工一天扣三天工资”显然超出了这一限制。

二、合理性分析

1. 违反比例原则：旷工行为与三倍工资的处罚明显失衡。例如，某员工日薪300元，旷工一天被扣900元，这种远超实际损失的处罚既不合理也不公平。

2. 涉嫌变相罚款：根据相关法律规定，罚款权专属于行政机关。企业自行设定高额扣款实质构成非法罚款，可能引发劳动纠纷。

3. 损害劳动关系：过度扣款会激化劳资矛盾，降低员工归属感。采用合理考勤制度的企业员工流失率通常比实施惩罚性扣款的企业低。

三、劳动者应对措施

1. 核查公司规章制度与合同：

   • 确认规章制度是否经民主程序制定并公示，未经员工签字确认或未公示的制度条款无效。
   • 检查劳动合同中是否明确约定旷工扣款规则，若无约定则企业无权单方扣款。

2. 与公司协商沟通：

   • 以书面形式提出异议，引用具体法律条款说明扣款违法性。
   • 要求公司提供扣款依据，包括经济损失证明、制度公示记录等。
   • 建议按实际缺勤天数扣款，或通过补班、绩效扣分等方式替代罚款。

3. 寻求外部帮助：

   • 劳动监察投诉：向当地人力资源和社会保障局劳动监察部门提交书面投诉材料，附证据清单（工资条、考勤记录、制度文件等）。
   • 申请劳动仲裁：准备仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明及扣款凭证。可主张返还违法扣款、支付经济补偿金（若因此解除劳动合同）。
   • 法律诉讼途径：对仲裁结果不服的，可在15日内向法院提起诉讼，需提供新证据支持诉求。

4. 保留关键证据：

   • 保存劳动合同、工资单、考勤记录原件。
   • 收集制度培训签到表、电子邮件通知等公示证明。
   • 记录协商过程（录音需征得对方同意）。

总结与建议：公司规定旷工一天扣三天工资，这样的规定不仅违法，而且不合理。作为劳动者，你有权维护自己的合法权益。在遇到这种情况时，建议先核查公司规章制度与合同，与公司进行协商沟通；若协商无果，可寻求劳动监察部门的帮助或申请劳动仲裁；必要时，还可通过法律诉讼途径来维护自己的权益。同时，保留好关键证据也是非常重要的。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。