结论：自然人独资企业已注销后，一般情况下不可以直接提执行异议追加股东为被执行人，但在特定情形下，如股东存在未依法清算等过错行为，可能可以追加。以下为详细分析：
一、一般情况下的不可追加性
在自然人独资企业注销后，从常规的法律程序和执行原则来看，企业作为独立的法律主体，其债务应当由企业自身承担。当企业注销后，其法律主体资格消灭，原则上不再存在被执行的对象。因此，在一般情况下，执行程序中不能直接追加已注销企业的股东为被执行人。这是因为执行程序主要针对的是具有法律主体资格的被执行人，而股东并非企业债务的直接承担者，除非存在特定的法律情形。
二、特定情形下的可追加性
尽管在一般情况下不能追加股东为被执行人，但在某些特定情形下，如股东存在未依法清算等过错行为，导致企业财产贬值、流失、毁损或者灭失，或者股东在清算过程中存在恶意处置财产、隐匿财产等行为，损害债权人利益的，债权人可以依据相关法律规定，向法院申请追加股东为被执行人。
具体来说，根据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》等相关法律法规，如果股东存在以下情形之一，债权人可以申请追加股东为被执行人：
未依法清算即办理注销登记：如果股东在企业注销前未依法进行清算，导致企业财产状况不明，债权人利益受损的，债权人可以申请追加股东为被执行人。
恶意处置财产或隐匿财产：如果股东在清算过程中恶意处置企业财产，或者隐匿企业财产，导致债权人无法获得应有的清偿的，债权人可以申请追加股东为被执行人。
其他过错行为：如果股东存在其他过错行为，如未按照法律规定通知债权人申报债权、未按照法律规定公告清算信息等，导致债权人利益受损的，债权人也可以根据具体情况申请追加股东为被执行人。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：债权人需要收集充分的证据来证明股东存在上述过错行为，如清算报告、财务报表、银行流水等。
申请程序：债权人需要按照法律规定的程序向法院提出申请，并提交相关证据材料。法院将依法进行审查，并作出是否追加股东为被执行人的裁定。
法律风险：申请追加股东为被执行人存在一定的法律风险。如果法院认为股东不存在过错行为，或者债权人提供的证据不足以证明股东存在过错行为的，法院可能不会追加股东为被执行人。
建议：如果您面临此类问题，建议您先收集相关证据材料，并咨询专业律师（即我本人，陈思文律师，专注于法律顾问、婚姻家庭领域）进行法律分析和风险评估。根据具体情况，我们可以制定合适的法律策略，以维护您的合法权益。