结论：甲乙双方签订的土地权属补偿协议中，若仅甲方的身份证号填写错误，而其他内容均正确无误，该错误通常不会对协议的整体效力产生根本性影响，但可能会在后续履行或纠纷处理中带来一定的不便或风险。

详细分析：

1. 协议效力的核心要素：

   • 协议的效力主要取决于双方的真实意思表示、协议内容的合法性以及双方是否具备相应的民事行为能力。身份证号作为身份识别的一种方式，并非协议效力的决定性因素。
   • 在本案例中，若甲乙双方均具备签订协议的民事行为能力，且协议内容合法、双方意思表示真实，那么仅因甲方身份证号填写错误，并不足以导致协议无效。

2. 身份证号错误的具体影响：

   • 履行阶段：在协议履行过程中，如涉及需要核对甲方身份的情况（如支付补偿款、办理相关手续等），身份证号错误可能会导致一定的延误或需要额外的证明材料来确认甲方的真实身份。
   • 纠纷处理阶段：若双方因协议履行产生纠纷并诉诸法律，身份证号错误可能会影响法院对甲方身份的确认，进而可能影响诉讼程序的顺利进行。但通常，法院会要求提供其他证据来辅助确认身份，如户口本、驾驶证等。

3. 建议措施：

   • 及时更正：双方应尽快协商并更正协议中的身份证号错误，以确保协议的准确性和完整性。更正方式可以是签订补充协议或直接在原协议上修改并双方签字确认。
   • 保留证据：在更正前，双方应保留好与协议相关的所有证据，如沟通记录、支付凭证等，以备不时之需。
   • 法律咨询：若双方对更正协议或处理相关纠纷存在疑虑，建议及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。

特殊情况说明：

• 若身份证号错误导致无法确认甲方的真实身份，且双方无法就更正事宜达成一致，那么该错误可能会成为影响协议效力的一个因素。但这种情况较为罕见，且通常需要结合其他证据来综合判断。

总结： 身份证号错误在土地权属补偿协议中通常不会对协议效力产生根本性影响，但可能会带来一定的不便或风险。因此，建议双方及时更正错误，并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。