核心结论：合同中不含税金额正确但含税金额错误，需根据合同签订阶段、错误原因及双方协商情况，通过补充协议修正、单方通知补正或诉讼/仲裁解决。以下是具体处理方式：

1. 协商一致签订补充协议

• 适用场景：合同已签订但尚未履行，或双方对错误无争议。
• 操作方式：双方可就含税金额错误部分签订补充协议，明确修正后的金额及生效时间。例如，若原合同不含税金额为100万元，税率13%，但含税金额误写为110万元（正确应为113万元），补充协议可直接修正含税金额为113万元。
• 法律依据：根据《民法典》第543条，当事人协商一致可变更合同。

2. 单方通知补正（需对方无异议）

• 适用场景：错误明显（如计算错误），且对方未提出异议。
• 操作方式：一方可书面通知对方修正含税金额，并附计算依据（如税率、不含税金额等）。若对方未在合理期限内提出异议，可视为认可修正。
• 风险提示：若对方拒绝认可，单方通知可能无效，需进一步协商或诉讼。

3. 诉讼/仲裁解决争议

• 适用场景：双方对错误性质（如是否为笔误）、修正方式或责任承担存在争议。
• 操作方式：
  • 主张合同变更：若错误因一方过失导致（如财务计算错误），可依据《民法典》第147条（重大误解）或第151条（显失公平）请求法院/仲裁机构变更合同。
  • 主张合同撤销：若错误严重到影响合同目的（如含税金额低于成本价），可请求撤销合同并返还已履行部分。
• 证据要求：需提供合同文本、计算依据、沟通记录等证明错误存在及对方知情情况。

4. 税务合规处理

• 核心原则：含税金额错误可能影响发票开具及税务申报，需同步修正税务记录。
• 操作方式：
  • 若含税金额调增：需向对方补开发票差额部分，并申报增收的增值税及附加税。
  • 若含税金额调减：需红冲原发票并重新开具，同时申报减收的税款（可能涉及退税或抵缴后续税款）。
• 风险提示：未及时修正税务记录可能导致虚开发票风险，需严格按《税收征收管理法》及《发票管理办法》操作。

5. 预防性措施

• 合同条款设计：在合同中明确“含税金额以不含税金额×（1+税率）计算为准”，避免歧义。
• 审核流程：签订前由财务、法务双重审核金额计算，确保与税务申报一致。
• 沟通留痕：对金额修正的协商过程保留书面记录（如邮件、微信），作为后续争议证据。

总结：含税金额错误需优先通过协商解决，若无法达成一致，可依据法律程序主张变更或撤销合同，同时务必同步修正税务记录以规避合规风险。如有具体合同文本或争议细节，可进一步提供信息以便针对性分析。