企业主张横向课题知识产权独有是否合法，需根据具体情况判断，主要取决于课题合同约定、知识产权归属原则及各方贡献等因素。以下从不同角度详细分析：

1. 合同约定优先原则

• 核心依据：根据《民法典》第八百六十三条，技术合同（包括委托开发合同、合作开发合同）对知识产权归属有约定的，从其约定。这是处理横向课题知识产权归属的首要原则。
• 具体分析：若企业与高校、科研机构等合作方在课题合同中明确约定知识产权归企业独有，且该约定不违反法律强制性规定（如公共利益、国家安全等），则企业主张独有合法有效。
• 例外情形：若合同未约定或约定不明，则需依据法定规则或各方贡献分配知识产权。

2. 合作开发合同的知识产权归属规则

• 法定规则：根据《民法典》第八百六十条，合作开发完成的技术秘密成果，知识产权归属由合作方约定；未约定或约定不明的，申请专利的权利属于合作完成的各方共有，但一方转让其共有专利申请权的，其他方有优先受让权。
• 具体分析：若横向课题属于合作开发性质，且合同未明确约定知识产权归企业独有，则企业与高校、科研机构等合作方可能共有知识产权。此时企业主张独有可能缺乏法律依据。
• 例外情形：若企业能证明其对课题完成贡献显著超过其他合作方（如提供全部资金、核心技术人员等），可能通过协商或诉讼争取更多权益，但需以合同或法律为依据。

3. 委托开发合同的知识产权归属规则

• 法定规则：根据《民法典》第八百五十九条，委托开发完成的发明创造，除法律另有规定或当事人另有约定外，申请专利的权利属于研究开发人（如高校、科研机构）。
• 具体分析：若横向课题属于委托开发性质，且合同未明确约定知识产权归企业独有，则知识产权可能归研究开发人所有。企业仅享有优先受让权或使用许可权。
• 例外情形：若合同明确约定知识产权归企业独有，且研究开发人同意转让或授权，则企业主张独有合法。

4. 职务发明与个人发明的区分

• 核心依据：根据《专利法》第六条，执行本单位任务或主要利用本单位物质技术条件完成的发明创造为职务发明，知识产权归单位所有；非职务发明则归发明人所有。
• 具体分析：若横向课题中，发明创造由企业员工完成且属于职务行为，则知识产权归企业所有；若由高校、科研机构人员完成且不属于职务行为，则知识产权可能归其个人或所在机构所有。
• 例外情形：若企业与高校、科研机构约定由企业提供物质技术条件，但发明创造主要由高校、科研机构人员完成，则需根据合同约定或实际贡献分配知识产权。

5. 法律建议与风险提示

• 合同签订阶段：企业应在课题合同中明确约定知识产权归属、使用范围、保密义务等条款，避免后续纠纷。
• 合作过程中：企业应保留资金投入、技术指导、人员参与等证据，以证明其对课题完成的贡献。
• 纠纷解决阶段：若发生知识产权归属争议，企业可优先通过协商解决；协商不成时，可依据合同约定或法律规定向法院起诉或申请仲裁。

总结：企业主张横向课题知识产权独有是否合法，需结合课题性质（合作开发或委托开发）、合同约定、各方贡献及法律规定综合判断。建议企业在签订合同时明确约定知识产权归属，并在合作过程中保留相关证据，以维护自身合法权益。如有具体案件或合同条款需要分析，可直接向我咨询。