结论：挪用有限公司款项已归还，是否违法需根据具体情况判断。若行为人明知是公司款项而故意挪用，并满足挪用资金罪的构成要件，则构成犯罪；若行为人因不知情而误用公司款项，并及时归还，通常不构成犯罪，但仍可能承担民事赔偿责任或违反单位规章制度。
一、构成挪用资金罪的情况
法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十二条，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，满足以下条件之一的，即构成挪用资金罪：
- 超期未还型：数额较大（通常为1万元至10万元以上，具体数额标准可能因地区而异）、超过三个月未还。
- 营利活动型：数额较大，进行营利活动。
- 非法活动型：进行非法活动，数额标准通常较低，且无数额较大之要求，但司法实践中通常以一定数额（如5000元至10000元）为追究刑事责任的起点。
法律责任：对于挪用资金罪，处三年以下有期徒刑或者拘役；挪用本单位资金数额巨大的，或者数额较大不退还的，处三年以上十年以下有期徒刑。
举例说明：假设某公司财务人员张某，利用职务便利，将公司资金10万元挪用于个人炒股（营利活动），并在三个月内归还。若该行为被认定为数额较大，则张某构成挪用资金罪，可能面临三年以下有期徒刑或者拘役的处罚。
二、不构成挪用资金罪的情况
一般不构成犯罪：若行为人因不知情而误将公司款项当作普通款项用于临时周转个人事务，并在发现错误后及时归还，且未进行非法活动或营利活动，由于其缺乏挪用资金的主观故意，一般不构成挪用资金罪。
可能承担的责任：
- 民事赔偿责任：即使不知情挪用公司款项，若给公司造成经济损失，仍需根据《中华人民共和国民法典》的相关规定承担民事赔偿责任。例如，因挪用款项导致公司无法及时支付供应商货款，从而产生违约金或利息损失，行为人需承担赔偿责任。
- 违反单位规章制度：公司内部通常有严格的财务管理制度和工作流程，不知情挪用公司款项也可能违反这些规定，导致纪律处分，如警告、罚款、降职、辞退等。
三、特殊情况下的法律责任
- 挪用资金用于非法活动：即使挪用资金数额不大，且已及时归还，但若用于非法活动（如赌博、贩毒等），仍可能构成挪用资金罪，并面临较重的刑事处罚。
- 多次挪用资金：若行为人多次挪用公司资金，即使每次数额不大，但累计数额较大或情节严重，也可能构成挪用资金罪。
四、建议与提醒
- 增强法律意识：公司员工应增强法律意识，明确挪用公司款项的严重后果，避免触犯法律。
- 完善内部管理：公司应完善内部财务管理制度，加强资金监管，防止员工挪用资金。
- 及时咨询律师：若对公司款项的挪用行为存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以便得到准确的法律意见和指导。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。