将政府采购中的实质要求作为加分项，属于违法行为，其处罚主要依据相关法律法规对违规行为的处理规定进行，具体处罚措施需根据违规情节的严重程度来确定。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律背景与规定

在政府采购活动中，实质要求通常指的是对供应商资质、产品性能、服务标准等核心条件的明确规定。这些要求应当作为采购活动的准入门槛，即供应商必须满足这些条件才能参与投标。然而，如果将这些实质要求同时作为加分项，就意味着在满足基本条件的基础上，供应商还能因为满足这些要求而获得额外的评分优势，这实际上是对采购规则的扭曲，可能构成不公平竞争。

根据《中华人民共和国政府采购法》及相关实施条例，政府采购活动应当遵循公开透明原则、公平竞争原则、公正原则和诚实信用原则。将实质要求作为加分项，显然违反了公平竞争原则，可能损害其他供应商的合法权益。

二、可能的法律后果与处罚

1. 采购活动无效：

   • 如果发现将实质要求作为加分项的行为，且该行为影响了采购结果的公正性，采购活动可能被宣告无效。这意味着已经进行的采购流程需要重新开始，包括重新发布采购公告、重新组织评标等。

2. 对违规供应商的处罚：

   • 对于参与违规行为的供应商，如果其通过不正当手段获得了加分并因此中标，可能面临中标无效、罚款、列入不良行为记录名单等处罚。
   • 具体处罚措施可能包括：没收违法所得、处以采购金额一定比例的罚款（如千分之五以上千分之十以下的罚款）、禁止在一定期限内参加政府采购活动等。

3. 对采购人或代理机构的处罚：

   • 如果采购人或代理机构在采购过程中存在违规行为，如故意将实质要求作为加分项以偏袒特定供应商，可能面临警告、罚款、没收违法所得、责令改正等处罚。
   • 对于情节严重的，还可能对直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予处分，甚至追究刑事责任。

三、实际操作中的建议

1. 严格审查采购文件：

   • 采购人或代理机构在编制采购文件时，应严格审查各项要求，确保实质要求仅作为准入门槛，而不作为加分项。

2. 加强监督与审计：

   • 相关部门应加强对政府采购活动的监督与审计，及时发现并纠正违规行为，确保采购活动的公正性和透明度。

3. 提高法律意识与合规意识：

   • 采购人、代理机构以及供应商都应提高法律意识与合规意识，了解并遵守政府采购相关法律法规，避免违规行为的发生。

如有任何关于政府采购或相关法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我将结合你的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。