针对您提出的“国企侵吞公款两万元怎么处理”的问题，这确实是一个涉及法律责任和公司管理的重要议题。以下是我根据相关法律法规和一般处理流程，为您提供的详细解答：
一、法律定性
在国企中，若国家工作人员利用职务便利侵吞、窃取、骗取或以其他手段非法占有公共财物两万元，这一行为根据相关司法解释，可能涉嫌贪污罪。尽管贪污数额在一万元以上不满三万元时，并不直接构成重罪，但如果存在特定情形（如曾因贪污、受贿等受过党纪、行政处分；曾因故意犯罪受过刑事追究；赃款赃物用于非法活动等），则应认定为“其他较重情节”，依法可判处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金。
二、处理方式
刑事程序：
- 一旦发现此类行为，应立即向监察机关报案。监察机关将负责进行调查，收集证据，查明事实真相。
- 调查终结后，监察机关会将案件移送检察机关审查起诉。检察机关将根据调查结果和法律规定，决定是否向人民法院提起公诉。
- 人民法院将依法进行审判，根据犯罪情节和法律规定，作出相应的判决。
追赃挽损：
- 在刑事程序进行的同时，司法机关会依法追缴侵占的财产，确保公共财物能够返还给受害单位，即国企。
内部处理：
- 除了法律制裁外，国企内部也应依据相关规定对行为人进行纪律处分。这可能包括警告、记过、降职、撤职甚至开除等。
- 同时，国企应加强内部控制和监管机制，防止类似事件再次发生。这包括完善财务管理制度、加强审计监督、提高员工法治意识和职业道德水平等。
三、通用建议
- 证据收集：在处理此类事件时，证据的收集至关重要。国企应保留所有与侵占行为相关的证据，如财务记录、交易凭证、监控录像等，以确保后续法律程序的顺利进行。
- 律师协助：在追回财产或寻求法律帮助时，国企可考虑聘请专业律师提供法律建议和支持。律师将能够协助国企制定合适的法律策略，确保权益得到最大程度的保护。
- 公示与警示：为了防止类似事件再次发生，国企可对侵占行为进行内部公示，以儆效尤。同时，加强员工法治教育和职业道德培训，提高员工的法律意识和道德水平。
综上所述，国企侵吞公款两万元的行为可能涉嫌贪污罪，应依法进行刑事程序处理，并追缴侵占的财产。同时，国企内部也应加强纪律处分和内部控制机制，以防止类似事件再次发生。希望这些解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。