公司更改绩效方案降低员工工资是否合法，需根据具体情况和法律规定来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合法情形
劳动合同或规章制度有明确约定：
- 如果劳动合同或公司的规章制度中明确约定了公司可以根据绩效考核结果调整工资，并且对绩效的考核标准、降薪的具体幅度和条件等都有详细、合理的规定，同时这些规章制度也经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）并向劳动者进行了公示告知，那么公司依据这些既定规则进行降薪通常是合法的。
- 举例：某公司劳动合同中明确规定，员工连续两个季度绩效考核不达标，公司有权将其薪资降低10%。若该规定经过民主程序制定并公示，且员工在签订劳动合同时已知悉，则公司依据此规定降薪合法。
与劳动者协商一致：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，且应当采用书面形式。因此，如果公司与劳动者就绩效降薪事宜进行了充分沟通并达成一致，签订了书面的变更协议，这种降薪行为也是合法的。
- 举例：公司因市场环境变化，需要调整绩效方案以降低人力成本，与员工进行协商后，员工同意接受新的绩效方案及相应的薪资调整，并签订了书面协议，则此降薪行为合法。
确保不低于最低工资标准：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，国家实行最低工资保障制度，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。因此，即使公司因绩效调整而降低员工薪资，也必须确保降低后的薪资不低于当地的最低工资标准。
- 举例：某地区最低工资标准为2000元/月，公司因绩效调整将某员工薪资降至1800元/月，则此降薪行为违法，因为低于了最低工资标准。
不合法情形
缺乏明确约定和合法程序：
- 如果劳动合同或公司规章制度中没有关于绩效降薪的相关约定，或者规章制度未经民主程序制定、未向劳动者公示，公司单方面以绩效为由降薪，则属于擅自变更劳动合同的主要内容，是不合法的。
- 举例：公司未与员工协商，也未在劳动合同或规章制度中约定绩效降薪条款，突然以绩效不达标为由降低员工薪资，则此降薪行为违法。
绩效考核不公正不合理：
- 如果公司的绩效考核体系存在明显的不合理、不公正情况，如考核指标模糊不清、考核过程缺乏监督和反馈机制、随意确定绩效结果等，以此为依据进行降薪也是不合法的。
- 举例：公司绩效考核指标过于主观，且考核过程不透明，员工对考核结果有异议但无法申诉，公司以此为由降薪，则此降薪行为可能违法。
恶意逼迫员工离职：
- 公司通过不合理地调整绩效、大幅降薪等手段试图逼迫员工主动离职，以逃避支付经济补偿等法律责任的行为，违背了法律的公平原则和保护劳动者权益的精神，同样是不合法的。
- 举例：公司为逼迫某员工离职，故意将其绩效评为不达标，并大幅降低其薪资，导致员工无法维持基本生活而被迫离职，则此降薪行为违法。
员工应对措施
如果劳动者认为公司的绩效降薪行为不合法或不合理，可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
与公司沟通协商：首先尝试与公司进行沟通协商，要求公司说明降薪的依据和理由，并表达自己的诉求和理由。
向劳动行政部门举报或投诉：如果协商无果，可以向当地的劳动行政部门举报或投诉公司的违法行为。
申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，劳动者可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，依法维护自己的合法权益。
总结：公司更改绩效方案降低员工工资的合法性取决于多个因素的综合判断。用人单位在调整员工薪酬时，必须严格遵守相关法律法规和劳动合同的约定，尊重员工的权益和意愿。若劳动者认为公司的降薪行为不合法或不合理，应积极采取措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。