科学技术部印制的技术转让合同上盖合同专用章是可以的。以下从多个角度为你详细分析：

合同专用章的法律效力

合同专用章是专门用于签订合同的印章，在合同上加盖合同专用章，通常表明合同双方对合同内容的认可和接受，是合同生效的重要条件之一。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。因此，在技术转让合同上加盖合同专用章，是符合法律规定的，能够产生合同成立的法律效力。

科学技术部印制合同的特殊性

科学技术部印制的技术转让合同，往往具有特定的格式和内容要求，这些要求通常是为了确保技术转让的合法性和有效性。然而，这些格式和内容要求并不涉及合同印章的使用。也就是说，无论合同是由哪个部门印制的，只要合同内容合法、双方意思表示真实，且加盖了有效的印章（如合同专用章），该合同就具有法律效力。

实际操作中的注意事项

1. 确保印章的真实性：在加盖合同专用章前，应确保该印章是真实有效的，避免使用伪造或变造的印章。
2. 核对合同内容：在加盖印章前，应仔细核对合同内容，确保合同条款符合双方的真实意思表示，且没有遗漏或错误。
3. 保留印章使用记录：为了防范法律风险，建议保留印章使用的相关记录，如印章使用审批表、印章使用登记簿等。

可能的法律后果

如果技术转让合同上加盖了合同专用章，但合同内容存在违法或欺诈等情形，那么该合同可能被认定为无效或可撤销。然而，这并不影响合同专用章本身的法律效力。也就是说，即使合同无效或可撤销，也不能否认在合同上加盖合同专用章这一行为本身的合法性。

总结与建议：在科学技术部印制的技术转让合同上加盖合同专用章是合法的，且能够产生合同成立的法律效力。为了确保合同的合法性和有效性，建议在加盖印章前仔细核对合同内容，并保留印章使用的相关记录。如果你在合同签订或履行过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。