在违法转包的情况下，对工程合同价款的罚款是否以实际竣工结算价为准，这并非一个绝对的问题，而是需要根据具体情况和相关法律法规来综合判断。以下从几个角度进行分析：

1. 合同约定优先：

   • 如果原工程合同中明确规定了违法转包时的罚款计算方式，并且该方式是以合同价款为基础进行计算的，那么首先应当遵循合同中的约定。
   • 若合同中约定罚款以合同价款（而非实际竣工结算价）为计算基础，那么即使实际竣工结算价与合同价款存在差异，罚款的计算也应以合同价款为准。

2. 实际竣工结算价的影响：

   • 在没有合同明确约定的情况下，或者合同约定不明确时，实际竣工结算价可能成为一个重要的参考因素。
   • 如果违法转包行为导致了工程成本的增加或减少，且这些变化在最终的实际竣工结算价中得到了体现，那么在实际操作中，可能会考虑以实际竣工结算价作为罚款计算的参考基础，但这并非绝对，还需结合其他因素综合判断。

3. 法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规，违法转包是明确禁止的行为，并可能面临罚款等行政处罚。
   • 法律法规对于罚款的计算方式可能并未具体规定是以合同价款还是实际竣工结算价为准，这给了行政机关一定的自由裁量权。
   • 在实际操作中，行政机关可能会根据违法行为的性质、情节以及造成的后果等因素，综合确定罚款的数额，其中可能包括考虑合同价款或实际竣工结算价。

4. 司法实践中的考量：

   • 在司法实践中，法院在审理涉及违法转包的案件时，也会综合考虑合同约定、实际履行情况、法律法规的规定以及公平原则等因素，来确定罚款的计算方式。
   • 如果实际竣工结算价更能反映违法转包行为对工程成本的实际影响，且没有合同明确约定以合同价款为计算基础，那么法院可能会倾向于以实际竣工结算价作为罚款计算的参考。

法律建议：

• 在处理违法转包案件时，建议首先查阅原工程合同中的相关条款，明确合同中对于罚款计算方式的规定。
• 如果合同中没有明确规定或规定不明确，建议咨询专业律师，结合实际情况和法律法规的规定，综合判断罚款的计算方式。
• 在实际操作中，应尽可能保留与工程成本、实际竣工结算价等相关的证据材料，以便在需要时提供有力的支持。

可能后果：

• 如果以合同价款为准计算罚款，可能无法完全反映违法转包行为对工程成本的实际影响，导致罚款数额与实际情况存在偏差。
• 如果以实际竣工结算价为准计算罚款，虽然可能更贴近实际情况，但也可能面临合同约定不明确、证据材料不足等挑战。

综上所述，违法转包中处工程合同价款的罚款是否以实际竣工结算价为准，需要根据合同约定、实际情况、法律法规的规定以及司法实践中的考量等因素综合判断。如有具体案件或疑问，建议直接向我咨询，以便提供更具体的法律建议。