事业单位工作人员被刑事拘留在逃或批准逮捕在逃的，其工资待遇应停发。具体分析如下：

1. 法律依据与原则
   根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第二十二条及《关于事业单位工作人员和机关工人被采取刑事强制措施和受刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》等规定，事业单位工作人员因涉嫌违法犯罪被采取刑事强制措施（如刑事拘留、逮捕）且在逃的，单位应暂停其工资发放。这一处理基于“无过错不支付”原则，即在法律程序未明确其无罪前，暂停支付工资符合公共利益和财政纪律要求。

2. 具体处理方式

   • 停发工资范围：包括基本工资、绩效工资、津贴补贴等全部工资性收入。
     
   • 停发时间：自被采取刑事强制措施（如刑事拘留）或批准逮捕之日起计算，直至法律程序终结（如判决生效、撤销案件等）。
     
   • 例外情形：若后续经法院判决无罪或免予刑事处罚，且未受行政处分的，可补发停发期间的工资；若受行政处分，则按处分规定处理工资待遇。

3. 后续程序衔接

   • 单位义务：事业单位需在知悉员工被采取刑事强制措施后10个工作日内，向主管部门报告并停发工资，同时将相关材料报同级人社部门备案。
     
   • 法律程序影响：若员工在逃期间被追回，单位应根据司法机关的最终处理结果（如判决、不起诉决定等）调整工资待遇；若长期在逃，工资停发状态将持续至法律程序终结。

4. 实务建议

   • 单位操作：建议事业单位在处理此类情况时，保留刑事强制措施文书、在逃证明等材料，确保程序合规。
     
   • 员工权利：若员工或家属认为处理不当，可在法律程序终结后，通过行政申诉或诉讼途径主张权利（如补发工资、恢复待遇等）。

总结：事业单位工作人员在逃期间工资停发是法定处理方式，单位需严格履行程序义务，员工或家属需关注法律程序进展以维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。