结论：针对您提出的“反担保的担保期限已过，合同有自动续签条款”的情况，需分情况讨论合同自动续签的效力及后续处理方式。以下从法律角度为您详细分析：

一、合同自动续签条款的效力

1. 条款合法性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方可以约定合同期限届满后自动续签的条款，只要该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，即具有法律效力。

2. 条款明确性：

   • 自动续签条款应当明确约定续签的条件、期限、方式等关键内容。若条款表述模糊或存在歧义，可能引发争议。此时，应依据合同的整体内容、交易习惯以及诚实信用原则进行解释。

二、担保期限已过与自动续签的关系

1. 担保期限的独立性：

   • 担保期限是担保合同中约定的担保人承担担保责任的期间。即使主合同（如反担保合同）存在自动续签条款，担保期限的届满并不自动导致担保责任的终止，除非担保合同中另有约定或法律另有规定。

2. 自动续签对担保期限的影响：

   • 若反担保合同中明确约定了自动续签条款，并且该条款也适用于担保期限，那么担保期限可能随之延长。但需注意，担保期限的延长应得到担保人的明确同意，否则可能构成对担保人权益的不当侵害。

三、后续处理方式

1. 审查合同条款：

   • 首先，应仔细审查反担保合同中的自动续签条款和担保期限条款，明确双方的权利和义务。

2. 与担保人协商：

   • 若担保期限已过，且合同存在自动续签条款，但担保人不同意继续承担担保责任，应及时与担保人进行协商，寻求解决方案。如协商不成，可考虑通过法律途径解决争议。

3. 考虑法律后果：

   • 若担保人不同意继续承担担保责任，而反担保合同中的自动续签条款被认定为有效，那么主债务人可能需要寻找其他担保方式或承担相应的法律责任。

4. 及时采取法律措施：

   • 在担保期限即将届满或已届满的情况下，若主债务人希望继续获得担保支持，应及时与担保人沟通并签订新的担保合同或补充协议，以明确双方的权利和义务。

四、特殊情况下的处理

• 若自动续签条款存在瑕疵：如自动续签条款因违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗而被认定为无效，那么担保期限不会因自动续签而延长。此时，主债务人应尽快与担保人协商新的担保方案。

• 若担保人主张免责：担保人可能以担保期限已过为由主张免责。在此情况下，主债务人应提供充分证据证明自动续签条款的有效性以及担保人对此的明知和同意。

建议：针对您当前的情况，我建议您首先仔细审查反担保合同中的相关条款，特别是自动续签条款和担保期限条款。然后，与担保人进行沟通，明确双方的权利和义务。如有必要，可寻求专业法律帮助，以确保您的权益得到妥善保护。您可以直接向我咨询相关法律问题，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。