结论：楼顶漏水使用大修基金但低层业主不同意的情况下，是可以向法院起诉的，但能否成功使用大修基金还需根据具体情况和法律规定来判断。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《物业管理条例》及相关规定，业主大会或者业主委员会的决定，对业主具有约束力。当楼顶等公共部分出现漏水等需要维修的情况时，通常可以通过业主大会或业主委员会来决定使用大修基金进行维修。
   • 如果低层业主不同意使用大修基金，而其他业主（包括高层业主）认为有必要进行维修，且该维修属于大修基金的使用范围，那么可以通过法律途径来解决争议。

2. 起诉条件：

   • 主体资格：起诉方应为业主或业主委员会，且能够证明自己是该物业的合法业主或代表业主利益的合法组织。
   • 事实依据：需要提供楼顶漏水的相关证据，如照片、视频、维修报告等，以及证明该维修属于大修基金使用范围的相关规定或业主大会决议。
   • 法律依据：需要引用相关法律法规，如《物业管理条例》等，来支持自己的主张。

3. 可能的结果：

   • 成功使用大修基金：如果法院认定楼顶漏水确实需要维修，且该维修属于大修基金的使用范围，同时起诉方提供了充分的证据和法律依据，那么法院可能会判决支持使用大修基金进行维修。
   • 驳回起诉或不支持使用大修基金：如果起诉方未能提供充分的证据或法律依据，或者法院认为该维修不属于大修基金的使用范围，或者存在其他法定事由（如大修基金余额不足等），那么法院可能会驳回起诉或不支持使用大修基金。

4. 建议与注意事项：

   • 协商解决：在起诉之前，建议先尝试与低层业主进行协商，寻求共识和解决方案。协商解决不仅可以节省时间和成本，还可以维护业主之间的和谐关系。
   • 收集证据：如果协商无果，决定起诉的话，一定要提前收集好相关证据，如楼顶漏水的照片、视频、维修报告等，以及证明该维修属于大修基金使用范围的相关规定或业主大会决议。
   • 咨询专业律师：在起诉过程中，建议咨询专业律师的意见和帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

后续行动建议：

• 如果您决定起诉，建议尽快收集相关证据和法律依据，并咨询专业律师的意见和帮助。
• 在起诉过程中，保持与法院和对方的沟通联系，及时了解案件进展情况，并根据需要调整自己的诉讼策略。

如果您在房产问题（物业纠纷）方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。