结论：在楼顶漏水且业主不同意动用维修基金的情况下，是否可以起诉需分情况讨论。一般来说，若满足法定条件且协商无果，可以通过法律途径维护权益，但直接起诉不同意动用维修基金的业主并非首选方案，而是应优先考虑通过业主大会表决、申请调解等合法途径解决。

详细分析：

1. 明确维修基金的使用条件与程序：

   • 维修基金（或称大修基金）是专项用于物业共用部位、共用设施设备保修期满后的大修、中修和更新、改造的资金。
   • 使用维修基金需遵循法定程序，通常包括提出维修方案、预算、召开业主大会进行表决等步骤。根据《民法典》规定，参与表决的专有部分面积和人数均需达到三分之二以上，且表决结果需符合相关规定（如双过半同意）。

2. 分析业主不同意的可能原因：

   • 业主可能对漏水原因、维修方案、费用分摊等存在疑虑或不满。
   • 业主可能对维修基金的使用规则、管理透明度等存在不信任。

3. 协商与沟通：

   • 在采取法律行动前，应首先尝试与不同意的业主进行深入沟通，了解他们的具体顾虑和反对原因。
   • 向业主详细解释房屋维修基金的性质、使用范围、申请流程及屋顶漏水的紧迫性，以消除误解和疑虑。

4. 遵循法定表决程序：

   • 召开业主大会，按照法定程序进行表决，确保维修基金的使用符合大多数业主的意愿。
   • 及时公示相关信息，包括漏水情况、维修方案、费用预算及表决结果，确保信息公开透明。

5. 寻求外部协助与调解：

   • 若协商无果，可请求街道办事处或社区居委会介入调解，以促成双方达成一致意见。

6. 法律途径的考虑：

   • 在满足法定条件且必要的情况下，如漏水问题严重影响房屋安全或居住环境，且其他途径均无法解决时，可以考虑通过法律途径维护权益。
   • 但直接起诉不同意动用维修基金的业主并非首选方案，因为维修基金的使用需遵循法定程序和多数业主的意愿。更合理的做法是起诉物业公司（如物业公司未履行维修责任）或通过业主委员会申请强制执行业主大会的表决结果（如表决结果符合法定条件）。

7. 替代方案的考虑：

   • 若部分业主仍坚决不同意动用维修基金，可提出替代方案，如业主自行筹集资金进行维修、申请政府补贴等。
   • 评估各种方案的可行性和经济性，选择最优解以尽快解决漏水问题。

建议与后果：

• 建议：在处理楼顶漏水问题时，应优先考虑通过协商、沟通、表决等合法途径解决。若确实无法达成一致意见且漏水问题严重，可咨询专业律师（即向我咨询）以获取更具体的法律建议和操作方案。
• 后果：若未经法定程序擅自使用维修基金或采取其他不当措施，可能面临法律责任和纠纷。因此，务必遵循法定程序和规定以维护自身权益和避免不必要的法律风险。