关于村民合作建房合同的效力问题，这是一个涉及多个法律层面的复杂议题。以下，我将从合同双方当事人的主体资格、意思表示的真实性、合同内容的合法性、合同的形式和程序，以及无效合同的处理等几个方面，为您进行详细解析。
一、合同双方当事人的主体资格
民事行为能力：签订合作建房合同的双方当事人必须具备相应的民事行为能力。这意味着，他们必须是年满18周岁且精神正常的自然人，或者是依法设立并具有相应民事权利能力和行为能力的法人、非法人组织。
主体适格性：特别需要注意的是，根据《中华人民共和国土地管理法》的规定，农村住宅用地仅限于本集体经济组织成员享有使用权。因此，在合作建房的情境中，若涉及农村集体经济组织成员，该成员必须具有本集体经济组织成员资格。若不具备这一资格，合同可能因主体不适格而被认定为无效。
二、意思表示的真实性
合同双方在订立合同时，必须基于真实意愿进行协商并达成一致。这意味着，合同中不能存在欺诈、胁迫、重大误解等导致意思表示不真实的情形。这是确保合同有效性的关键要素之一，因为只有真实的意思表示才能反映双方的真实意愿和合法权益。
三、合同内容的合法性
不违反法律强制性规定：合作建房合同的内容必须严格遵守国家的法律法规，特别是与土地管理和房地产相关的法律。例如，合同不得违反土地管理法关于农村土地用途的规定，不得在农用地上违规建房，也不得通过合作建房变相进行房地产开发用于对外销售。
不损害国家、集体或他人利益：合同内容不能损害国家利益、社会公共利益以及他人合法权益。这包括但不限于破坏公共基础设施、影响相邻关系等。若合同内容存在这些违法或损害利益的情况，合同将被视为无效。
四、合同的形式和程序
书面形式：虽然法律没有明确规定农村合作建房合同必须采用书面形式，但为了避免纠纷和确保合同的明确性，建议采用书面形式签订，并详细记载合作建房的各项条款。这有助于在发生争议时提供明确的证据。
审批程序：如果合作建房涉及农用地的转用或其他需要办理审批手续的情况，必须按照法定程序进行审批。未经审批擅自建设的，将面临法律制裁，合同也可能因此被认定为无效。
五、无效合同的处理
如果农村合作建房合同被认定为无效，根据法律规定，合同双方应当根据各自的过错程度承担相应的责任。例如，因一方原因导致合同无效的，该方可能需要赔偿对方因此遭受的损失。同时，无效合同自始没有法律约束力，双方应恢复到合同签订前的状态。
总结与建议：
农村合作建房合同的法律效力是一个复杂的问题，涉及多个方面的法律规定。在签订合作建房合同时，当事人务必谨慎审查合同条款，确保合同符合法律法规的要求。特别是要关注合同双方当事人的主体资格、意思表示的真实性、合同内容的合法性以及合同的形式和程序等方面。为了降低法律风险，建议在签订合同前咨询专业律师的意见，以确保合同的合法性和有效性。