关于摩托新车安装踏板货架后发生交通事故保险是否赔偿的问题，结论需分情况讨论，主要取决于改装是否合法、是否履行了告知义务以及改装与事故的因果关系。以下是具体分析：

1. 若改装合法且已告知保险公司
   根据《保险法》第16条，投保人需如实告知保险标的的重要情况（如改装）。若您在安装踏板货架后及时通知保险公司，并经其审核同意（可能需补充材料或调整保费），则保险合同继续有效。此时发生事故，保险公司通常需按合同赔偿，除非事故直接由非法改装导致（如货架超重影响制动）。

2. 若改装非法或未告知保险公司

   • 非法改装：根据《道路交通安全法》第16条，擅自改变机动车结构、构造或特征（如加装超出车辆设计载重的货架）属于违法行为。若事故与非法改装有关（如货架松动导致侧翻），保险公司可能依据《保险法》第27条或合同条款拒赔。
     
   • 未履行告知义务：若改装合法但未通知保险公司，根据《保险法》第52条，保险人有权在知道解除事由后30日内解除合同；若未解除，发生事故时可能按比例赔付或拒赔，具体需结合合同条款和法院裁判倾向。

3. 关键例外情形

   • 事故与改装无关：若事故由第三方全责导致（如被追尾），且改装未影响车辆安全性能，保险公司通常需赔偿，但可能主张扣除改装部分对应的残值。
     
   • 保险公司未尽提示义务：若保险合同中“免责条款”未以加粗、斜体等方式显著提示，且您能证明未收到明确说明，该条款可能不生效（《保险法》第17条）。

建议行动：

1. 立即检查保险合同中的“改装条款”和“免责情形”；
   
2. 保留改装合法性证明（如货架合格证、安装店资质）；
   
3. 若已发生事故，尽快联系保险公司报案，并同步咨询律师分析事故责任与改装关联性。
   

如有进一步细节（如改装是否报备、事故责任认定等），可直接向我补充提问，我会结合具体情形为您细化分析。