针对您提出的“医疗器械法人利用自己无二类备案资质的个体工商户销售医疗器械如何处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：
一、明确结论
未取得第二类医疗器械经营备案凭证而经营第二类医疗器械的行为，属于明确的违法行为，将依法面临一系列严厉的处罚措施，包括但不限于责令限期改正、没收违法所得与物品以及罚款等。
二、法律依据
- 《医疗器械监督管理条例》：该条例明确规定，从事第二类医疗器械经营必须进行备案，否则将承担相应的法律责任。
- 《医疗器械经营监督管理办法》：此办法详细规定了医疗器械经营的具体要求和监管措施，为处罚违法经营行为提供了明确的操作依据。
三、处罚措施详解
责令限期改正：
- 药品监督管理部门在发现违法行为后，会首先要求违法者在规定期限内完成第二类医疗器械经营备案，以使其经营行为合法化。
没收违法所得与物品：
- 若在未备案期间有违法所得（即通过经营医疗器械获得的收入），这些收入将被依法没收。
- 同时，未备案的第二类医疗器械产品，以及用于违法经营的工具、设备、原材料等物品，也将被依法没收。
罚款：
- 一般情况：
- 若货值金额不足1万元，将并处1万元以上3万元以下的罚款。例如，如果某个体工商户经营的未备案医疗器械货值5000元，那么可能面临1万元至3万元的罚款。
- 若货值金额1万元以上，将并处货值金额3倍以上10倍以下的罚款。如某个体工商户违法经营的货值达5万元，则可能面临15万元至50万元的罚款。
- 逾期不改正的情况：
- 如果违法者在规定期限内未完成备案或未停止违法行为，将处5万元以上10万元以下的罚款。
- 情节严重的，如多次违法或造成严重后果的，将并处10万元以上20万元以下的罚款。
其他相关处罚：
- 药品监督管理部门可能会向社会公告违法单位和产品名称，以警示公众。
- 对于情节严重的违法行为，还可能对违法单位的法定代表人、主要负责人等责任人员实施个人罚款，并禁止其在一定期限内甚至终身从事医疗器械生产经营活动。
- 如果违法行为构成犯罪，如涉及诈骗、非法经营等，将依法追究刑事责任。
四、重要提示
- 具体法律责任可能因案件具体情况、地区差异以及执法部门的裁量权而有所不同。因此，在面临此类问题时，建议咨询相关执法部门或专业律师以获取最准确的法律意见。
- 为避免法律风险和经济损失，建议在经营医疗器械前充分了解并遵守相关法律法规和规定，确保经营行为的合法性。特别是对于第二类医疗器械的经营，必须按照要求进行备案，并严格遵守经营过程中的各项规定。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。