结论：奶奶与她弟弟签署的养老协议若合法有效，且该协议涉及财产处分与养老安排，那么孙女代位继承的房产份额可能会受到影响，具体份额多少需根据协议内容、房产情况及法律规定综合判断。以下从多个角度进行分析：
一、养老协议的法律效力
协议内容合法性：
- 养老协议若明确约定了奶奶将其财产（包括房产）给予弟弟，作为弟弟承担养老责任的交换，且该协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则该协议具有法律效力。
协议对财产处分的影响：
- 一旦协议生效，奶奶对协议中涉及的财产（如房产）的处分权将受到限制。在奶奶去世后，该房产可能按照协议约定归弟弟所有，或者作为奶奶遗产的一部分，但弟弟可能因履行了养老义务而享有优先受偿权或特定份额。
二、代位继承的法律适用
代位继承的条件：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，被继承人的子女先于被继承人死亡的，由被继承人的子女的直系晚辈血亲代位继承。在本案例中，若奶奶的子女（即孙女的父母）先于奶奶去世，则孙女有权代位继承奶奶的遗产。
代位继承的份额：
- 代位继承人一般只能继承被代位继承人有权继承的遗产份额。若奶奶与弟弟签署的养老协议影响了房产的归属或份额分配，则孙女代位继承的份额将相应减少。具体份额需根据协议内容、房产情况及法律规定综合判断。
三、可能的情况分析
协议完全履行且房产归弟弟所有：
- 若养老协议完全履行，且协议中明确约定房产归弟弟所有，则奶奶去世后，该房产可能不再属于奶奶的遗产范围，孙女无法代位继承该房产。
协议部分履行或房产部分归属：
- 若养老协议部分履行，或协议中未明确约定房产全部归弟弟所有，而是约定了弟弟享有特定份额或优先受偿权，则奶奶去世后，该房产可能仍属于奶奶的遗产范围，但弟弟可能因履行了养老义务而享有优先受偿权或特定份额。此时，孙女代位继承的份额将相应减少。
协议无效或可撤销：
- 若养老协议存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫、显失公平等），则该协议可能被法院宣告无效或撤销。在此情况下，房产可能仍属于奶奶的遗产范围，孙女有权代位继承其应得的份额。
四、建议与措施
审查养老协议：
- 建议孙女及其家属仔细审查养老协议的内容，了解协议对房产处分和养老安排的具体约定。
咨询专业律师：
- 若对养老协议的法律效力或代位继承的份额存在疑问，建议咨询专业律师（即向我咨询），以便根据具体情况提供法律意见和解决方案。
收集证据材料：
- 在处理此类纠纷时，收集相关证据材料（如养老协议、房产证明、亲属关系证明等）至关重要。这些证据材料将有助于证明各方的主张和权益。
考虑和解或诉讼：
- 若各方对房产份额存在争议且无法协商解决，可考虑通过和解或诉讼的方式解决纠纷。在此过程中，专业律师的协助将至关重要。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。