关于居委会开父子关系证明是否有效的问题，这主要取决于该证明的具体用途以及相关法律法规或机构的具体要求。
首先，从一般法律原则来看，居委会作为基层群众性自治组织，其出具的证明在一定程度上可以反映社区内居民的基本情况和关系。然而，对于父子关系这种具有法律效力的亲属关系证明，其有效性和认可度可能因具体情境而异。
公证办理等特定用途：
- 如果该父子关系证明是用于公证办理等特定法律程序，那么通常需要更权威、更具有法律效力的证明文件。在这种情况下，居委会出具的证明可能仅作为辅助材料，而主要的证明文件应由公安机关（如派出所）出具，因为公安机关是户籍管理的法定机构，其出具的亲属关系证明具有更高的法律效力。
- 以您提供的参考信息为例，在“(出具)亲属关系证明(限于公证办理)”的情境中，虽然居委会可以办理，但明确指出了这是“限于公证办理”，且可能仍需要现场核查材料，这暗示了居委会证明在公证办理中的辅助性质。
一般社区事务或非法律程序：
- 如果该父子关系证明是用于一般社区事务或非法律程序，如社区服务、学校入学等，那么居委会出具的证明通常是被接受的，因为这些情境对证明文件的法律效力要求相对较低。
法律法规和机构要求：
- 无论何种情况，都应首先查阅相关法律法规或机构的具体要求，以确定居委会出具的父子关系证明是否被接受。不同地区、不同机构可能有不同的规定和要求。
建议：
- 如果您需要开具父子关系证明，且该证明将用于法律程序或具有较高法律效力的情境，建议您直接前往公安机关（如派出所）办理，以确保证明的有效性和认可度。
- 如果该证明仅用于一般社区事务或非法律程序，您可以先咨询相关机构或部门是否接受居委会出具的证明，以避免不必要的麻烦和延误。
综上所述，居委会开父子关系证明的有效性取决于具体用途和相关法律法规或机构的要求。在不确定的情况下，建议您直接咨询相关机构或部门以获取准确的信息和指导。