离职后未遵守保密协议，用人单位起诉通常是有效的，但具体需根据保密协议的内容、签订情况以及劳动者的行为来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

保密协议的法律效力基础

1. 法定义务与约定义务：保守用人单位的商业秘密是劳动者的法定义务，这一义务源自诚实信用原则。同时，双方也可以通过签订保密协议，将这一义务具体化、明确化，形成约定义务。保密协议一旦签订，即对双方具有法律约束力。

2. 协议内容合法性：保密协议的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得损害社会公共利益。例如，协议中不得约定过长的保密期限、过高的违约金等不合理条款。只要协议内容合法，且双方真实意愿表示一致，保密协议即具有法律效力。

离职后未遵守保密协议的法律后果

1. 违约责任：如果劳动者离职后未遵守保密协议，泄露了用人单位的商业秘密，并给用人单位造成了损失，用人单位有权要求劳动者承担违约责任。违约责任的形式可能包括赔偿损失、支付违约金等。

2. 诉讼有效性：用人单位因劳动者违反保密协议而提起诉讼，法院会根据保密协议的合法性、劳动者的违约行为以及用人单位的损失情况等因素，综合判断用人单位的诉讼请求是否成立。如果保密协议合法有效，且劳动者的违约行为确实给用人单位造成了损失，法院通常会支持用人单位的诉讼请求。

特殊情况下的协议效力

1. 未支付保密费用：保密协议的有效性通常并不取决于用人单位是否支付了保密费用。因为保守商业秘密是劳动者的法定义务，不以支付保密费为前提。但是，如果协议中明确约定了保密费用的支付，且用人单位未支付，劳动者可以以此为由主张协议部分无效或要求用人单位支付保密费用。不过，这并不影响保密协议中其他合法条款的效力。

2. 竞业限制与保密协议的区别：需要注意的是，保密协议与竞业限制协议是不同的。竞业限制协议限制了劳动者在离职后的就业范围，且通常与经济补偿相关联。如果用人单位未支付竞业限制经济补偿，劳动者可以选择催告用人单位支付，并在合理期限内仍未支付时行使解除权，解除竞业限制协议。但保密协议并不涉及劳动者的就业选择，其效力不受经济补偿支付情况的影响。

法律建议

1. 签订前仔细阅读：劳动者在签订保密协议前，应仔细阅读协议条款，确保自身权益不受损害。特别是关于保密期限、保密义务、违约责任等方面的内容，需格外注意。

2. 离职后遵守协议：离职后，劳动者应继续遵守保密协议中的约定，不得泄露用人单位的商业秘密。如果因特殊情况需要披露，应事先征得用人单位的同意。

3. 遇到纠纷及时咨询：如果因保密协议产生纠纷，建议及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，以便更好地维护自己的合法权益。

如果你有具体的保密协议内容或纠纷情况，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律分析和建议。