公司司机加班费的计算是一个涉及多个因素的过程，需要严格遵循《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规的规定。以下是对公司司机加班费如何计算的详细解答：

一、加班情形及法律规定

根据《中华人民共和国劳动法》，加班主要分为以下三种情形，每种情形对应不同的加班费支付标准：

1. 延长工作时间加班：即平日加班，用人单位安排劳动者延长工作时间的，需支付不低于工资的150%的工资报酬。
2. 休息日加班：即周末加班，用人单位安排劳动者在休息日工作且不能安排补休的，需支付不低于工资的200%的工资报酬。若已安排补休，则无需支付加班费。
3. 法定休假日加班：用人单位安排劳动者在法定休假日工作的，需支付不低于工资的300%的工资报酬，且不能以补休代替。

二、加班费计算基数确定

加班费的计算基数通常是劳动者的月工资基数，具体确定方式如下：

1. 有约定的情况：如劳动合同或集体合同中明确约定了工资数额或加班工资基数，且该基数不低于当地最低工资标准，则按约定执行。
2. 无约定的情况：若劳动合同和集体合同均未对加班费计算基数作出约定，则通常按照劳动者本人正常出勤月工资的70%来确定（但实际操作中，很多地区或企业会直接采用正常出勤月工资作为基数，具体需参照当地规定或企业政策），且同样不得低于当地最低工资标准。这里的“正常出勤月工资”不包括加班工资、特殊工作环境和条件下的津贴等。

三、具体计算方法

1. 日工资和小时工资的折算：

   • 日工资：月工资收入÷月计薪天数（通常为21.75天）。
   • 小时工资：日工资÷8小时。

2. 不同加班情形下加班费的计算：

   • 延长工作时间加班费：小时工资×加班小时数×150%。
   • 休息日加班费：日工资×加班天数×200%（或小时工资×加班小时数×200%），若已安排补休则不支付。
   • 法定休假日加班费：日工资×加班天数×300%（或小时工资×加班小时数×300%）。

四、特殊工时制度下的加班费计算

1. 综合计算工时工作制：经劳动行政部门批准实行此制度的司机，在综合计算周期内的总实际工作时间超过总法定标准工作时间的部分，视为延长工作时间，按不低于小时工资标准的150%支付加班工资。法定休假日工作的，按不低于日或小时工资标准的300%支付加班工资。
2. 不定时工作制：一般情况下，不实行上述加班工资规定。但部分地区规定，在法定休假日工作的，也需按不低于日或小时工资标准的300%支付加班工资，具体需参照当地规定执行。

五、举例说明

假设司机小李月工资为5000元，在某个月内，工作日延长工作时间共3小时，休息日加班1天（每天工作8小时），法定休假日加班1天（工作8小时）。

• 计算小时工资：日工资 = 5000 ÷ 21.75 ≈ 229.89元；小时工资 = 229.89 ÷ 8 ≈ 28.74元。
• 计算加班费：
  • 延长工作时间加班费 = 28.74 × 3 × 150% ≈ 129.33元。
  • 休息日加班费 = 229.89 × 1 × 200% = 459.78元。
  • 法定休假日加班费 = 229.89 × 1 × 300% = 689.67元。
  • 该月小李的加班费总计 = 129.33 + 459.78 + 689.67 = 1278.78元。

六、注意事项

1. 司机在主张加班费时，需提供充分证据证明加班事实，如加班记录、考勤表等。
2. 用人单位应严格按照法律法规支付加班费，否则司机有权向劳动行政部门投诉并寻求法律救济，包括与单位协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等途径。

综上所述，公司司机加班费的计算应综合考虑加班情形、计算基数及工时制度等因素，并确保符合《中华人民共和国劳动法》的相关规定，以保障劳动者的合法权益。