结论：司机拿着运费跑了，是可以报案的。这种情况可能涉及侵占罪或诈骗罪等刑事犯罪，也可能仅涉及民事纠纷，具体取决于司机拿走运费的行为性质和情节。
分析角度一：刑事犯罪角度
侵占罪：如果司机在运输过程中，基于职务之便，将本应属于货主的运费非法占为己有，且数额较大，拒不归还，那么这种行为可能构成侵占罪。侵占罪是指以非法占有为目的，将他人的交给自己保管的财物、遗忘物或者埋藏物非法占为己有，数额较大，拒不交还的行为。在这种情况下，货主可以向公安机关报案，要求追究司机的刑事责任。
诈骗罪：如果司机在运输前或运输过程中，以虚构事实或隐瞒真相的方法，骗取货主的信任，使货主自愿将运费交给司机，而司机在拿到运费后却逃跑，那么这种行为可能构成诈骗罪。诈骗罪是指以非法占有为目的，使用欺骗方法，骗取数额较大的公私财物的行为。同样，货主也可以向公安机关报案，要求追究司机的刑事责任。
分析角度二：民事纠纷角度
如果司机拿走运费的行为并不构成刑事犯罪，比如是因为双方对运费有争议，或者司机认为货主未支付其他费用而擅自扣留运费等，那么这种情况可能仅涉及民事纠纷。在这种情况下，货主虽然也可以向公安机关报案，但公安机关可能不会将其作为刑事案件处理，而是建议货主通过民事诉讼等途径解决纠纷。
建议与行动：
收集证据：无论司机拿走运费的行为是否构成刑事犯罪，货主都应该首先收集相关证据，如运输合同、运费支付凭证、司机逃跑的证据等，以便在后续的法律程序中证明自己的权益。
报案处理：如果货主认为司机拿走运费的行为构成刑事犯罪，可以向当地公安机关报案，并提供相关证据。公安机关会根据证据情况决定是否立案侦查。
民事诉讼：如果公安机关认为不构成刑事犯罪，或者货主更希望通过民事途径解决纠纷，可以向法院提起民事诉讼，要求司机返还运费并赔偿相关损失。
咨询律师：在整个过程中，货主可以咨询专业律师（比如我，从文博律师，专注于离婚、交通事故领域，但在此类民事纠纷中也能提供法律咨询和帮助），以获取更具体的法律建议和指导。
后续思考：
在处理此类纠纷时，货主应保持冷静，不要采取过激行为。同时，要积极配合公安机关或法院的工作，提供必要的证据和信息。此外，货主在未来的运输合同中应明确约定运费的支付方式、时间和条件等，以避免类似纠纷的再次发生。