关于“事实占有房屋多年是否合法”的问题，结论需要分情况讨论：
如果事实占有是基于合法依据：
- 合法依据包括：如通过买卖、赠与、继承等合法方式取得房屋所有权，但尚未办理过户登记手续，此时虽然未取得法律上的产权证书，但基于合法的交易或继承关系，事实占有是合法的。
- 法律后果：在这种情况下，事实占有者有权要求原产权人协助办理过户登记手续，以确认其法律上的产权。如果原产权人拒绝配合，事实占有者可以通过法律途径维护自己的权益。
如果事实占有是无权占有：
- 无权占有的情形：如通过租赁、借用等方式取得房屋的使用权，但在租赁或借用期限届满后，未经原产权人同意继续占有房屋；或者通过非法手段如侵占、盗窃等方式取得房屋。
- 法律后果：
- 对于租赁或借用期限届满后的无权占有：原产权人有权要求事实占有者返还房屋，并可以要求其支付逾期占有期间的房屋使用费。如果事实占有者拒绝返还，原产权人可以通过法律途径申请强制执行。
- 对于非法手段取得的无权占有：原产权人不仅可以要求返还房屋，还可以要求事实占有者承担侵权责任，包括赔偿损失等。在极端情况下，如果事实占有者的行为构成犯罪，如盗窃罪，还可能面临刑事处罚。
关于“事实占有多年”对合法性的影响：
- 一般原则：事实占有的时间长短本身并不直接决定其合法性。合法性主要取决于占有的依据是否合法。
- 特殊情形：在某些情况下，如果事实占有者长期、公开、和平地占有房屋，并且原产权人在一定期限内未提出异议，事实占有者可能基于“时效取得”的原则获得房屋的所有权。但需要注意的是，我国法律并未明确规定“时效取得”制度，且在实际操作中，对于不动产的占有，通常要求以合法登记为取得所有权的前提。因此，在大多数情况下，不能仅凭事实占有多年就认为取得了房屋的所有权。
建议：
- 如果您是事实占有者，且认为自己的占有是基于合法依据的，建议您尽快办理相关的过户登记手续，以确认自己的法律产权。
- 如果您是原产权人，且发现有人无权占有您的房屋，建议您及时与对方沟通，要求其返还房屋。如果沟通无果，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
- 在任何情况下，都建议您咨询专业的法律人士，以获取更具体、更准确的法律建议。
最后，房屋产权问题涉及复杂的法律关系和权益平衡，如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。