结论：电动自行车改装2000W电机属于违法行为，交警有权罚款，且可能面临其他法律后果。以下是具体分析：

1. 法律定性：改装行为违反《道路交通安全法》及地方性法规
   根据《道路交通安全法》第十六条，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。电动自行车虽属于非机动车，但部分地区（如北京、上海）通过地方性法规明确规定：电动自行车的电机功率、电池电压等核心参数必须与产品合格证一致，改装即构成违法。例如，北京市《非机动车管理条例》第十八条直接禁止加装、改装电动机，违者由公安机关交通管理部门处500元以下罚款。

2. 处罚依据：交警执法权限明确
   若改装后的电动自行车被认定为“超标车”（即符合机动车标准但未登记为机动车），交警可依据《道路交通安全法》第九十五条，以“上道路行驶的机动车未悬挂机动车号牌”或“驾驶拼装的机动车”为由，扣留车辆并处200-2000元罚款，甚至吊销驾驶证（若驾驶人持有）。即使未被认定为机动车，仅改装行为本身也可能因违反地方性法规被罚款。

3. 潜在风险：不止罚款，还可能承担民事或刑事责任

   • 事故责任加重：改装导致车辆性能超出安全标准，若发生交通事故，法院可能依据《民法典》第一千二百零二条，认定改装者承担主要或全部赔偿责任。
     
   • 刑事风险：若改装车辆用于飙车、追逐竞驶等危险行为，可能涉嫌危险驾驶罪（《刑法》第一百三十三条之一），面临拘役和罚金。

建议：若已改装，应立即恢复原状；若考虑升级性能，建议通过合法途径更换符合标准的配件，并到车管所备案。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体地区的执法细则或风险防范措施。