结论前置：自离（自动离职）并不意味着用人单位可以随意扣除工资。工资的扣除需严格遵循劳动法的相关规定、公司的规章制度以及劳动合同的具体约定，且必须合法合理。

一、自离员工工资支付的基本原则

1. 工资支付义务：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。这一原则同样适用于自离员工。无论员工是主动离职还是其他原因离开，只要其提供了正常劳动，用人单位就有义务支付相应的劳动报酬。

2. 实际工作天数计算：自离员工的工资应当根据其在用人单位的实际工作天数来确定，并按照劳动合同中约定的工资标准进行结算。这意味着，员工应获得其已付出劳动部分的工资。

二、自离造成损失时的工资扣除规定

1. 经济损失赔偿：若劳动者自离给用人单位造成了经济损失，如未完成工作交接导致业务受损、数据丢失等，用人单位有权要求员工赔偿。但赔偿的金额需有充分证据支持，证明损失的存在及具体数额。

2. 工资扣除的限制：

   • 从员工工资中扣除赔偿金额时，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
   • 若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则用人单位需按最低工资标准支付。

计算公式：

• 每月可扣除的最大赔偿金额 = 劳动者当月工资 × 20%
• 扣除后应支付的最低工资 = 当地月最低工资标准（若扣除后的工资低于此标准）

示例：

• 假设员工小李月工资为6000元，因自离给公司造成了2000元损失。公司每月最多可从小李工资中扣除1200元（6000 × 20%）来弥补损失。若小李所在地的月最低工资标准为2500元，扣除1200元后，小李仍能获得4800元工资，高于最低工资标准，因此公司可按实际扣除后的金额支付。

三、自离员工工资支付的特殊情况与注意事项

1. 合法罚款：如果公司有明确的规章制度，且该制度经过民主程序制定并已向员工公示，员工因违反规定而被合法罚款后自离，公司可按规定扣除相应罚款后发放剩余工资。但同样需遵守上述扣除限制。

2. 非法罚款：若公司的罚款行为不合法或没有合理依据，员工自离时，公司不能以此为由随意扣减工资。员工有权要求公司足额支付工资。

四、自离员工工资支付的维权途径

1. 协商：首先，劳动者可以与用人单位进行协商，要求其支付应得的工资。这是最直接、最快捷的解决方式。

2. 投诉与仲裁：若协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者直接提起劳动仲裁。劳动仲裁委员会将依法进行裁决，保障劳动者的合法权益。

3. 诉讼：对劳动仲裁结果不满意的，劳动者还可以向法院提起诉讼，通过司法途径来维护自己的合法权益。

五、总结与建议

自离员工有权获得其实际工作期间的工资，这是由《劳动法》及《劳动合同法》明确规定的。用人单位在员工离职时，应遵守相关法律法规，确保工资支付的合法性和公平性。同时，劳动者也应了解自己的权益，并在必要时采取合适的维权措施来保护自己的合法权益。

建议：

• 劳动者在自离前应了解公司的规章制度和劳动合同的相关约定，避免因不了解规定而遭受不必要的损失。
• 自离后，若发现公司无故克扣工资或存在其他违法行为，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

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