结论：超市因您故意多次漏扫商品而罚款一千元的行为，在一般情况下是不合法的，超市无权直接对您进行罚款。
法律背景与解释：
超市的权限：
- 超市作为经营场所，其管理权限主要限于维护店内秩序和保障商品安全。当发现顾客有不当行为（如故意漏扫商品）时，超市可以采取的措施通常包括：要求顾客补交商品款项、阻止顾客离开并报警处理等。
- 超市并不具备行政处罚权或司法权，因此无权直接对顾客进行罚款。罚款是行政机关或司法机关在特定情况下对违法行为人采取的制裁措施，超市无权行使。
您的行为性质：
- 您故意多次漏扫商品的行为，可能构成盗窃或欺诈的违法行为，具体取决于漏扫商品的金额和次数。如果金额较大或次数较多，超市有权报警并由公安机关依法处理。
- 在超市发现您的行为后，您应积极配合超市的处理，如补交商品款项或接受公安机关的调查。
超市罚款的合法性：
- 超市罚款一千元的行为缺乏法律依据，属于非法行为。您有权拒绝支付这笔罚款，并可以向相关部门（如市场监管部门）投诉超市的违法行为。
- 如果超市因此事与您发生纠纷，您可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
法律建议：
- 与超市协商：您可以尝试与超市协商解决此事，说明自己的立场和理由，争取达成和解。但请注意，协商并不意味着您必须接受超市的不合理要求。
- 保留证据：在与超市交涉的过程中，请务必保留好相关证据（如购物小票、监控录像等），以备不时之需。
- 寻求法律帮助：如果超市坚持要求您支付罚款或采取其他不当措施，您可以及时向我咨询或寻求其他法律专业人士的帮助，以维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果您拒绝支付超市的非法罚款，超市可能会采取进一步措施（如报警、起诉等）。但请放心，只要您坚持自己的立场并寻求法律帮助，超市的非法要求是不会得到支持的。
- 如果您的行为确实构成盗窃或欺诈等违法行为，您可能会面临公安机关的调查和处理。但请相信，法律会公正地对待每一个人，只要您积极配合调查并承担相应的法律责任，事情会得到妥善解决的。