工程行业居间费超过5%是否合法，不能一概而论，其合法性取决于多个因素。以下从不同角度为你详细分析：
合法性判断依据
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于中介合同（居间合同）的规定，居间人向委托人报告订立合同的机会或提供订立合同的媒介服务，并据此获得报酬是合法的。这为工程居间费的收取提供了法律基础。
真实意思表示：
- 居间合同必须是双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫、重大误解等导致合同可撤销的情形。如果双方基于平等、自愿、公平的原则，就居间费的比例（包括超过5%）达成一致，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么该约定是合法的。
居间行为合法合规：
- 居间人必须在法律许可的范围内开展居间活动。如果居间行为本身违法，如通过行贿、提供虚假信息等不正当手段促成工程交易，那么整个居间合同可能被认定无效，居间费也无法得到法律支持。即使居间费比例未超过5%，也可能因居间行为违法而不被认可。
费用合理性：
- 虽然法律没有明确规定具体的居间费比例，但居间费应当合理，不应严重偏离市场正常水平。如果居间费比例过高，可能被视为显失公平或存在其他不合理情形，法院在审理相关纠纷时可能会根据实际情况进行调整。因此，即使双方约定了超过5%的居间费，但如果该比例严重偏离市场水平，也可能面临法律风险。
影响居间费比例的因素
地区差异：
- 不同地区的经济发展水平和行业惯例可能影响居间费的比例。在经济发达或行业竞争激烈的地区，居间费可能相对较低；而在经济欠发达或行业垄断性较强的地区，居间费可能相对较高。
工程规模与类型：
- 大型复杂的工程项目或特定类型的工程项目（如高利润项目）可能涉及更多的居间工作和风险，因此居间费可能相对较高。但这并不意味着可以随意设定过高的比例，仍需考虑费用的合理性。
签订居间合同时的注意事项
明确约定条款：
- 在签订居间合同时，双方应详细约定居间费的比例、支付方式、支付时间等关键条款，以避免后续纠纷。同时，合同内容应符合相关法律法规的规定，确保合同的合法性和有效性。
避免过高比例：
- 协商居间费比例时，应充分考虑项目的实际情况和市场条件，避免提出过高的要求。过高的居间费不仅可能引发法律风险，还可能损害双方的商业信誉和合作关系。
法律建议
- 在签订居间合同前：双方应充分了解市场行情和行业惯例，结合项目的实际情况和风险程度，合理确定居间费的比例。
- 在合同履行过程中：双方应严格遵守合同约定，确保居间行为的合法合规性，避免任何违法违规行为的发生。
- 在发生纠纷时：双方应首先通过协商解决争议；如果协商不成，可以寻求法律途径解决。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据相关法律法规和合同约定，对居间费的合法性进行审查和判断。
总之，工程行业居间费超过5%是否合法，取决于双方的真实意思表示、居间行为的合法合规性以及费用的合理性等多个因素。如果你在工程居间合同方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。