在建设工程领域，承包合同与确权证（如不动产权证或相关权属证明）的效力问题，需根据具体情况来判断以哪个为准。以下从不同角度进行分析：
一、合同效力优先的情况
合同内容明确且合法有效：
- 如果承包合同内容明确、合法有效，且双方均按照合同约定履行了各自义务，那么在没有其他相反证据的情况下，承包合同应作为确定双方权利义务的主要依据。
- 例如，合同中明确约定了工程范围、工期、质量标准、价款支付等关键条款，且这些条款均符合法律法规的规定，那么这些条款应被优先遵守。
确权证存在瑕疵或错误：
- 如果确权证（如不动产权证）存在瑕疵或错误，如登记内容与实际不符、登记程序违法等，那么确权证的效力可能会受到质疑。
- 在这种情况下，如果承包合同能够证明实际权利状况与确权证不符，那么承包合同应作为确定权利义务的依据。
二、确权证效力优先的情况
确权证具有公示公信力：
- 确权证（如不动产权证）是权利人享有物权的法定证明，具有公示公信力。在建设工程领域，如果工程已经竣工并办理了不动产权证，那么该证书应作为确定工程所有权的主要依据。
- 例如，在房屋买卖合同纠纷中，如果房屋已经办理了不动产权证，且买受人已经支付了合理对价并办理了过户手续，那么即使承包合同中存在与确权证不符的条款，也应以确权证为准。
合同内容违反法律法规或公序良俗：
- 如果承包合同的内容违反了法律法规的强制性规定或公序良俗，那么该合同可能被认定为无效或部分无效。
- 在这种情况下，即使合同中有关于工程权属的约定，也不能作为确定权利义务的依据。此时，应依据确权证或其他相关证据来确定实际权利状况。
三、综合判断的情况
合同与确权证相互印证：
- 在某些情况下，承包合同与确权证可能相互印证，共同构成确定权利义务的依据。例如，合同中明确约定了工程竣工后应办理不动产权证，且实际也办理了该证书，那么合同与确权证应共同作为确定权利义务的依据。
存在争议或纠纷时：
- 如果承包合同与确权证之间存在争议或纠纷，如双方对工程权属有不同理解或主张，那么应通过法律途径解决。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据合同内容、确权证效力、相关法律法规以及双方当事人的举证情况等综合判断，以确定最终的权利义务归属。
法律建议：
- 在签订承包合同时，应确保合同内容明确、合法有效，并尽可能与确权证的内容保持一致。
- 如果发现确权证存在瑕疵或错误，应及时向相关部门申请更正或撤销，以避免潜在的法律风险。
- 在发生争议或纠纷时，应及时咨询专业律师，了解自身权利义务，并采取合适的法律措施维护自身合法权益。
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