车辆停在待转区红灯亮了是否扣分，需根据具体情况判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、合法进入待转区后遇红灯停车
不扣分的情况：
- 如果车辆在直行或左转信号灯为绿灯时，合法进入待转区，随后红灯亮起，车辆在待转区内停车等待，这是符合交通规则的，不会被扣分。因为待转区的设置就是为了提高路口通行效率，允许车辆在特定信号条件下进入等待通行。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第五十一条和第三十八条的规定，机动车通过有交通信号灯控制的交叉路口时，遇停止信号时，应依次停在停止线以外。没有停止线的，停在路口以外。在待转区红灯停车，符合这一规定。
二、违规进入待转区后遇红灯停车
可能扣分的情况：
- 如果车辆在直行信号灯为红灯时，强行进入待转区，这可能被视为越线停车甚至闯红灯的违法行为。根据相关规定，可能会受到扣2分（越线停车）至6分（闯红灯）不等的处罚。
特殊情形：
- 如果车辆在红灯亮起之前，前轮已经越过停止线，并且是在确保安全的前提下继续行驶进入待转区的，那么这种情况可能不会被视为闯红灯，因此也就不会被扣分。但这一判断需结合具体交通情况和地方执法标准。
三、其他注意事项
影响交通秩序：
- 即使车辆在待转区红灯停车本身不扣分，但如果停车时间过长，影响了其他车道的正常通行，造成交通拥堵或安全隐患，可能会被认定为交通违法行为，从而受到扣分和罚款的处罚。
违反禁停标志：
- 如果待转区内有明确的禁停标志或标线，而车辆仍然在此停车，那么这种行为将被视为违章停车，同样会受到扣分和罚款的处罚。
四、建议与提醒
严格遵守交通规则：
- 驾驶员应密切关注交通信号灯的变化，并严格按照交通规则的指示行驶。在红灯亮起时，应停车等待，不得擅自进入待转区或其他禁止通行的区域。
注意交通标志和标线：
- 在进入待转区前，驾驶员应仔细观察路口的交通标志和标线，确保自己有权且合法地进入待转区。
确保安全停车：
- 在待转区红灯停车时，驾驶员应确保自己的停车行为不会影响其他车辆和行人的正常通行。同时，要密切关注交通信号灯的变化及周围的交通状况，以确保自身和他人的安全。
总结来说，车辆停在待转区红灯亮了是否扣分，关键在于车辆是否遵守了交通信号灯的指示以及是否正确使用了待转区。如果车辆是在绿灯或黄灯时进入待转区，并且随后因红灯亮起而停留在待转区内，那么这种行为不构成闯红灯，通常不会被扣分。但如果有违规行为或影响交通秩序等情况，则可能面临相应的处罚。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。