合作协议中约定“长期有效”或“永久有效”并非绝对，其有效性取决于多种因素的综合考量。以下从不同角度为你详细分析：
一、有效情形
意思表示真实且合法：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，合作协议若满足行为人具有民事行为能力、意思表示真实、不违反法律法规强制性规定及不违背公序良俗等条件，则“长期有效”或“永久有效”的约定通常有效。例如，两家企业基于平等自愿原则签订的技术合作协议，内容合法且双方充分理解无异议，该约定即具法律效力。
符合合同目的和交易习惯：
- 在特定商业场景中，如家族企业间的长期合作，基于信任和共同目标签订的长期合作协议，若符合行业惯例和合同目的，并在当地商业环境中被普遍认可，则该协议同样有效。
二、可能无效或可撤销情形
显失公平：
- 若合作协议中权利义务明显不对等，导致一方利益严重受损，根据《中华人民共和国民法典》第一百五十一条，利益受损方可请求法院或仲裁机构以显失公平为由撤销协议。例如，一方承担过多义务而享受极少权利，这种约定可能因显失公平而被撤销。
违反法律法规强制性规定：
- 合作协议内容若违反法律法规强制性规定，如从事非法传销活动，则该协议自始无效。即使约定了“长期有效”或“永久有效”，也无法改变其违法的本质。
损害公共利益：
- 协议若损害社会公共利益，如生产和销售严重污染环境的产品，将被认定为无效。这种约定不仅无法得到法律保护，还可能面临法律制裁。
三、法律原则与实际履行的限制
法律原则：
- 任何合同或协议均不能违背法律法规的强制性规定，否则协议无效。同时，合同双方应遵循公平、自愿、等价有偿和诚实信用的原则。即使约定了“长期有效”或“永久有效”，也必须遵守这些基本原则。
合同解除权：
- 根据《民法典》规定，特定情况下当事人可依法解除合同。例如，因不可抗力致使不能实现合同目的，或一方明确表示不履行主要债务等情形下，当事人可以解除合同。这说明“长期”或“永久”合作协议并非不可解除。
实际情况变化：
- 市场环境、业务需求等因素的变化可能影响协议的履行。即使协议中写明“长期有效”或“永久有效”，也不意味着必须一直履行。双方可根据实际情况协商调整或终止协议。例如，因市场变化导致合作项目无法继续盈利，双方可以协商终止协议。
四、建议
- 明确约定终止条件或期限：在签订合作协议时，建议双方明确约定具体的终止时间或终止条件。这样可以在未来出现变化时，有明确的依据来处理协议的终止或变更问题。
- 确保协议内容合法、公平：协议内容应符合法律法规的规定，不违背公序良俗。同时，双方的权利义务应相对平衡，避免显失公平的情况出现。
- 考虑未来变化因素：在签订协议时，应充分考虑未来可能出现的变化因素，如市场环境、法律法规的变化等。可以在协议中设置相应的条款来应对这些变化，如设置调整机制或解除条款等。
示例说明：假设甲乙两家企业签订了一份合作协议，约定共同开发一款新产品，并约定协议“长期有效”。在协议履行过程中，因市场环境发生变化，导致该产品无法继续盈利。此时，双方可以协商调整合作方式或终止协议。如果协议中明确约定了终止条件或期限，那么双方的处理将更加明确和顺畅。
综上所述，合作协议中约定“长期有效”或“永久有效”并非绝对有效或无效。其有效性取决于多种因素的综合考量，包括法律法规、合同法的规定以及实际情况的变化等。因此，在签订和履行合作协议时，双方应谨慎对待这些表述，并根据实际情况灵活处理。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。