学校领导贪污5万元，属于贪污行为，应当依法追究其刑事责任，并可能面临纪律处分和民事赔偿。具体处理方式如下：

1. 刑事责任：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条，国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的，是贪污罪。学校领导作为国家工作人员（如果属于公立学校或受国家委托管理公共财产的人员），贪污5万元，已达到贪污罪的立案标准。
   • 贪污数额较大（一般指3万元以上不满20万元）的，依法应处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金。
   • 具体量刑还会考虑贪污手段、是否退赃、是否有自首或立功情节等因素。

2. 纪律处分：

   • 除了刑事责任外，学校领导还可能面临党纪、政纪处分。根据《中国共产党纪律处分条例》和《事业单位工作人员处分暂行规定》，贪污行为属于严重违纪行为，可能面临开除党籍、开除公职等严厉处分。

3. 民事赔偿：

   • 如果贪污行为导致学校或他人财产损失，学校领导还需承担民事赔偿责任，即退还贪污所得并赔偿相关损失。

处理流程：

• 立案侦查：一旦发现贪污行为，学校或相关部门应立即向公安机关报案，由公安机关立案侦查。
• 审查起诉：侦查终结后，公安机关将案件移送检察机关审查起诉。检察机关认为犯罪事实清楚、证据确实充分的，将向法院提起公诉。
• 审判判决：法院依法审理案件，并根据事实和法律作出判决。

建议：

• 如果您是学校员工或学生，发现学校领导有贪污行为，应及时向学校纪检监察部门或上级主管部门举报。
• 如果您是受害者或相关利益方，可以积极配合调查，提供证据，并依法维护自己的合法权益。

如有进一步疑问或需要具体法律帮助，可以直接向我咨询。