关于摩托车冲红灯被小车撞后是否会被扣车的问题，这主要取决于事故的具体情况和交警部门的调查处理流程，但一般来说，单纯因摩托车冲红灯并不会直接导致车辆被扣，不过摩托车驾驶员会面临相应的交通违法处罚。以下从几个方面为你详细分析：

1. 交通违法处罚：

   • 摩托车作为机动车，其驾驶员若不按交通信号灯指示通行（即冲红灯），根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》及最新修订的《机动车驾驶证申领和使用规定》，将被一次记6分，并面临罚款处罚，通常罚款金额在20元以上200元以下，具体数额可能因地区和具体情况而有所差异。
   • 这意味着，摩托车驾驶员会因其违法行为受到行政处罚，但这并不直接等同于车辆会被扣留。

2. 事故责任认定：

   • 在摩托车冲红灯被小车撞的事故中，摩托车驾驶员通常会被认定为承担主要或全部责任，因为其违反了交通信号灯指示，增加了事故发生的风险。
   • 交警部门会根据事故现场勘查、证人证言、监控视频等证据，综合判断事故责任，并出具事故责任认定书。

3. 车辆扣留情况：

   • 车辆是否被扣留，通常取决于事故是否需要进一步调查、是否存在酒驾、毒驾等严重违法行为、车辆是否涉及其他违法犯罪活动等因素。
   • 如果事故现场需要保护、证据需要收集，或者摩托车驾驶员存在逃避处罚、拒绝配合调查等行为，交警部门可能会依法扣留车辆。
   • 但单纯因摩托车冲红灯这一违法行为，并不直接导致车辆被扣留。

4. 后续处理建议：

   • 如果摩托车驾驶员在事故中受伤，应首先确保自身安全，及时就医治疗。
   • 同时，应积极配合交警部门的调查处理工作，如实陈述事故经过，提供相关证据。
   • 如果对事故责任认定有异议，可以在规定时间内向上级交警部门申请复核。
   • 对于因事故造成的损失，可以根据事故责任认定书，与对方协商赔偿事宜，或者通过法律途径解决。

总结来说，摩托车冲红灯被小车撞后，车辆是否会被扣留取决于事故的具体情况和交警部门的调查处理流程。但无论如何，摩托车驾驶员都会因其违法行为面临相应的交通违法处罚。因此，建议摩托车驾驶员在行驶过程中严格遵守交通信号灯指示，确保自身和他人的安全。如果你还有其他关于交通运输或事故责任方面的问题，可以直接向我咨询。