针对门店仅调和汽车漆、不售卖但单独存有危险化学品的情况，处罚需结合具体违法情形，可能涉及行政处罚甚至刑事责任，具体分析如下：

一、若门店未取得危险化学品经营许可证或储存资质，属于“非法经营/储存危险化学品”

根据《危险化学品安全管理条例》第三十三条、第七十七条，国家对危险化学品经营（包括储存）实行许可制度。即使门店不直接售卖危险化学品，但若储存的汽车漆原料（如溶剂、稀释剂等）属于危险化学品（需核对《危险化学品目录》），且未取得应急管理部门颁发的《危险化学品经营许可证》或未在许可范围内储存，则构成违法。
处罚措施：

1. 由应急管理部门责令停止经营活动，没收违法经营的危险化学品及违法所得；
   
2. 处10万元以上20万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任（如非法经营罪）。
   

二、若储存条件不符合安全要求，属于“违反危险化学品储存规定”

即使门店有经营资质，但若储存场所未设置明显安全标志、未配备消防设施、未隔离存放或未定期检查等（具体要求见《危险化学品安全管理条例》第二十四条），则违反储存安全规定。
处罚措施：

1. 由应急管理部门责令改正，处5万元以上10万元以下的罚款；
   
2. 拒不改正的，责令停产停业整顿，直至吊销相关许可证件，并由原发证机关处10万元以上20万元以下的罚款；
   
3. 若因储存不当导致泄漏、爆炸等事故，可能涉嫌“危险物品肇事罪”（刑法第一百三十六条），需承担刑事责任。
   

三、若门店未如实记录储存情况或隐瞒危险化学品，属于“违反危险化学品登记制度”

根据《危险化学品安全管理条例》第六十七条，危险化学品生产企业、进口企业应向国务院安全生产监督管理部门登记，储存单位也需建立台账并报备。若门店未登记或隐瞒储存信息，可能被认定为“未如实记录”或“瞒报”。
处罚措施：
由应急管理部门责令改正，可处5万元以下的罚款；拒不改正的，处5万元以上10万元以下的罚款。

四、若门店调和汽车漆过程中产生废弃物未妥善处理，属于“违反危险废物管理规定”

汽车漆调和可能产生含危险化学品的废包装物、废溶剂等（需鉴定是否属于《国家危险废物名录》中的废物）。若未委托有资质的单位处理，或随意丢弃，则违反《固体废物污染环境防治法》。
处罚措施：
由生态环境主管部门责令改正，处所需处置费用三倍以上五倍以下的罚款（最低10万元，最高100万元）；情节严重的，报经有批准权的人民政府批准，责令停业或关闭。

实务建议

1. 立即自查：核对储存的汽车漆原料是否属于危险化学品（可查询《危险化学品目录》），检查储存场所是否符合安全要求（如通风、防火、防泄漏等）；
   
2. 补办手续：若未取得经营许可证，需尽快向应急管理部门申请；若已取得但超范围储存，需调整储存种类或数量；
   
3. 完善记录：建立危险化学品出入库台账，定期向监管部门报备；
   
4. 合规处理废弃物：与有资质的危废处理单位签订合同，保留转运联单等凭证。
   

提示：危险化学品管理涉及应急管理、生态环境、公安等多部门联合监管，处罚力度较大。若门店对是否属于危险化学品、储存要求等存在疑问，可直接向我咨询，我会结合具体物质名称、储存量等细节进一步分析。