结论：在工人离职时，双方协商先支付一部分款项并签订协议，是合法且可行的做法。以下是一份协议的示例框架及关键要点说明，供您参考。

协议示例框架

协议标题：离职结算协议

甲方（雇主）：[雇主全称]

乙方（工人）：[工人姓名]

鉴于：

1. 乙方因个人原因提出离职，并已与甲方就离职事宜达成一致。
2. 双方同意，在乙方正式离职前，甲方先向乙方支付部分款项，剩余款项将在约定时间内支付完毕。

协议内容：

1. 支付安排：

   • 甲方同意在乙方离职前，向乙方支付人民币[具体金额]元作为部分离职结算款。
   • 剩余款项人民币[具体金额]元，甲方将在[具体日期]前支付至乙方指定账户。

2. 双方权利与义务：

   • 乙方确认，在收到上述部分款项后，将继续履行其在职期间的职责直至正式离职日，并配合甲方完成工作交接。
   • 甲方承诺，将按照本协议约定的时间和金额支付剩余款项。

3. 保密条款：

   • 双方同意，本协议内容及双方在协商过程中所知悉的对方商业秘密、个人隐私等信息，均应予以保密，未经对方书面同意，不得向任何第三方披露。

4. 违约责任：

   • 如甲方未按本协议约定支付剩余款项，乙方有权要求甲方立即支付，并有权要求甲方承担因此产生的合理费用（如律师费、诉讼费等）。
   • 如乙方违反本协议约定，甲方有权要求乙方承担因此造成的损失。

5. 争议解决：

   • 双方因执行本协议发生争议，应首先通过友好协商解决；协商不成时，任何一方均有权向甲方所在地人民法院提起诉讼。

6. 其他：

   • 本协议自双方签字（或盖章）之日起生效，一式两份，甲乙双方各执一份，具有同等法律效力。

甲方（签字/盖章）：[雇主签字/盖章]

乙方（签字）：[工人签字]

日期：[签订日期]

关键要点说明

1. 明确支付安排：协议中应详细列明先支付和后支付的金额、时间，以及支付方式（如银行转账、现金等），以避免后续争议。

2. 双方权利与义务：明确双方在协议执行过程中的权利和义务，特别是乙方的在职责任和甲方的支付承诺，确保双方权益得到保障。

3. 保密条款：考虑到双方在协商过程中可能知悉对方的敏感信息，加入保密条款有助于保护双方的商业秘密和个人隐私。

4. 违约责任：明确违约责任和赔偿方式，有助于增强协议的约束力，确保双方能够按照协议履行义务。

5. 争议解决：约定争议解决方式，如协商、诉讼等，有助于在发生争议时快速、有效地解决问题。

建议：在签订协议前，双方应仔细阅读协议内容，确保理解并同意其中的各项条款。如有需要，可以寻求专业法律人士的帮助，以确保协议的合法性和有效性。如果您在协议签订或执行过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。