公司合并后，原告的诉讼主体资格问题通常通过以下方式解决：

1. 吸收合并中的原告主体资格
   若合并为吸收合并（A公司吸收B公司，B公司注销），根据《公司法》第174条及《民事诉讼法》司法解释第63条，诉讼权利义务由存续公司承继。例如：B公司作为原告的未决诉讼，合并后自动由A公司作为原告继续参与；若B公司为被告，则A公司作为被告应诉。
   关键点：需以工商登记的合并公告或注销证明为证据，证明合并事实及权利义务承继关系。

2. 新设合并中的原告主体资格
   若合并为新设合并（A、B公司合并设立C公司，A、B均注销），诉讼权利义务由新设公司C承继。例如：原A公司作为原告的合同纠纷，合并后需变更诉讼主体为C公司；若原A、B公司均为被告，则C公司作为共同被告应诉。
   关键点：需提交合并协议、新公司章程及工商登记材料，证明新设公司承继关系。

3. 诉讼程序中的主体变更
   根据《民事诉讼法》第153条，法院可依职权或当事人申请变更诉讼主体。实践中，原告需向法院提交：

   • 合并协议或决议；
     
   • 工商部门出具的合并登记证明；
     
   • 公告材料（如涉及债权人通知）。
     注意：若合并导致原告丧失诉讼利益（如原公司权利被新公司排除），法院可能驳回起诉或要求重新明确诉求。

4. 特殊情形处理

   • 合并前纠纷：若纠纷源于合并前行为（如原公司侵权），即使合并后仍由存续/新设公司承担责任，但需区分个人责任与公司责任（如董事个人过错需追加为共同被告）。
     
   • 跨境合并：涉及外商投资企业合并时，需符合《外商投资法》及商务部门审批要求，诉讼主体资格需以审批文件为准。
     
   • 破产程序中的合并：若合并公司已进入破产程序，诉讼主体资格由管理人承继，原告需向管理人申报债权而非直接起诉。

建议行动步骤：

1. 核查合并类型（吸收/新设）及工商登记状态；
   
2. 收集合并协议、公告、登记证明等文件；
   
3. 向法院提交主体变更申请，附证据材料；
   
4. 若合并导致诉讼利益变化，及时调整诉求或追加被告。
   

如有具体案情或证据材料，可进一步向我咨询细节。